35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0020 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0020  hypothetical protein  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.671617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1243  hypothetical protein  46.05 
 
 
236 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1579  hypothetical protein  41.45 
 
 
236 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000182235  unclonable  0.000000174169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2396  hypothetical protein  41.7 
 
 
396 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4098  hypothetical protein  42.54 
 
 
246 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64495  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2179  hypothetical protein  42.73 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.701349  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1844  hypothetical protein  42.29 
 
 
236 aa  142  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5319  hypothetical protein  39.62 
 
 
238 aa  141  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1795  hypothetical protein  40 
 
 
223 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0348  hypothetical protein  32.91 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.773589  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2723  hypothetical protein  38.33 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.214242 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5015  hypothetical protein  42.71 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2618  hypothetical protein  37.28 
 
 
227 aa  112  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0343997  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2456  hypothetical protein  33.94 
 
 
247 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0904442  normal  0.102517 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0176  hypothetical protein  30.23 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.504348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3141  hypothetical protein  33.48 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0482  hypothetical protein  31.63 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1735  hypothetical protein  30.23 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.370565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0868  hypothetical protein  31.94 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3073  hypothetical protein  32.74 
 
 
234 aa  96.3  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1101  hypothetical protein  31.94 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1586  hypothetical protein  29.77 
 
 
236 aa  95.5  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1676  hypothetical protein  30 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6499  hypothetical protein  32.58 
 
 
232 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  0.0462955 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5939  hypothetical protein  32.89 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471017  normal  0.0147378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2711  hypothetical protein  27.08 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1383  hypothetical protein  28.9 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1569  hypothetical protein  28.24 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.862522  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2631  hypothetical protein  28.97 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2061  hypothetical protein  30.7 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1717  hypothetical protein  30.23 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.757154  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3577  dihydroneopterin aldolase  40.21 
 
 
397 aa  58.5  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0954558  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1240  hypothetical protein  24.22 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0226  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating]  36.67 
 
 
288 aa  42.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1872  nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase  29.59 
 
 
276 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.228495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>