More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2723 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
378 aa  770    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 
376 aa  285  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  41.95 
 
 
361 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  43.9 
 
 
368 aa  282  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  42.51 
 
 
372 aa  275  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  40.48 
 
 
375 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  40.92 
 
 
363 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  40.92 
 
 
363 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  41.91 
 
 
361 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  41.07 
 
 
363 aa  242  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  39.68 
 
 
361 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  40.77 
 
 
366 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  38.4 
 
 
367 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  39.5 
 
 
367 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  41.44 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  39.78 
 
 
367 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  41.22 
 
 
364 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 
365 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 
365 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 
365 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  38.04 
 
 
365 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
380 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  30.85 
 
 
369 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  30.85 
 
 
369 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  30.85 
 
 
369 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  30.3 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  30 
 
 
369 aa  179  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  30.83 
 
 
369 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  30.64 
 
 
369 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  30.14 
 
 
369 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  30.3 
 
 
369 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  30.83 
 
 
369 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  29.48 
 
 
369 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  31.55 
 
 
378 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  33.15 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  32.09 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  32.36 
 
 
375 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  33.68 
 
 
405 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.03 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
379 aa  145  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  35.42 
 
 
385 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 
411 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  34.75 
 
 
652 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.89 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.63 
 
 
372 aa  139  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  33.43 
 
 
666 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  32.81 
 
 
360 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  31.1 
 
 
371 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  32.32 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  33.14 
 
 
666 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  31.23 
 
 
367 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  32.88 
 
 
392 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  33.25 
 
 
384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  27.92 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  32.7 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  31.41 
 
 
376 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  33.24 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 
402 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3117  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.76 
 
 
432 aa  124  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459659  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  31.52 
 
 
371 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.64 
 
 
1033 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.25 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  33.24 
 
 
652 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  32.58 
 
 
375 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.48 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5322  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.75 
 
 
434 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.116126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.65 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  31.3 
 
 
684 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.47 
 
 
433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5270  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.52 
 
 
434 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0829502  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5526  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.29 
 
 
434 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.89 
 
 
385 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  30.19 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  29.02 
 
 
375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.95 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5180  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.29 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  30.46 
 
 
406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 
413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.52 
 
 
433 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229652 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.78 
 
 
367 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0101  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.44 
 
 
433 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.22 
 
 
369 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
420 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 
393 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3994  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.42 
 
 
441 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
373 aa  106  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.5 
 
 
369 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0235  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.06 
 
 
433 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  27.49 
 
 
428 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 
377 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
393 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.5 
 
 
369 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2746  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.4 
 
 
434 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0984937  decreased coverage  0.0000603863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0245  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.31 
 
 
432 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2240  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.7 
 
 
428 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6078  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.74 
 
 
432 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  24.66 
 
 
371 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>