More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2547 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  816    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  56 
 
 
392 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  54.66 
 
 
393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  54.16 
 
 
392 aa  441  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  55.1 
 
 
392 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  55.73 
 
 
392 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  55.44 
 
 
405 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  55.25 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  55.7 
 
 
392 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  53.79 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  55.7 
 
 
392 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  53.15 
 
 
392 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  55.47 
 
 
411 aa  435  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  59.49 
 
 
414 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  53.55 
 
 
398 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  55.98 
 
 
393 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3018  hypothetical protein  58.06 
 
 
404 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943538  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  53.81 
 
 
398 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  53.3 
 
 
398 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  54.41 
 
 
393 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  53.81 
 
 
398 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  53.81 
 
 
398 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  53.62 
 
 
414 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  57 
 
 
399 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  53.81 
 
 
397 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  55.47 
 
 
393 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  55.08 
 
 
397 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  54.48 
 
 
394 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  50.37 
 
 
405 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  53.75 
 
 
406 aa  424  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  54.95 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  54.95 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  51.38 
 
 
394 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  54.57 
 
 
400 aa  422  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  54.95 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  54.03 
 
 
410 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  56.67 
 
 
416 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  54.95 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  54.18 
 
 
394 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  54.95 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  53.05 
 
 
399 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  54.57 
 
 
400 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  54.57 
 
 
400 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  53.55 
 
 
460 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  53.55 
 
 
398 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  54.02 
 
 
401 aa  423  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  55.56 
 
 
405 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  54.95 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  54.57 
 
 
400 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  54.95 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  54.15 
 
 
413 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  54.57 
 
 
400 aa  422  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  53.3 
 
 
460 aa  421  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  54.05 
 
 
400 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  54.31 
 
 
400 aa  421  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  54.29 
 
 
393 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  53.67 
 
 
394 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  53.65 
 
 
392 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  54.8 
 
 
407 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  52.33 
 
 
415 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  54.31 
 
 
400 aa  420  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  52.79 
 
 
394 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  55.05 
 
 
407 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  54.05 
 
 
400 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  54.03 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  54.11 
 
 
412 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  53.3 
 
 
399 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  55.33 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  53.55 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  55.03 
 
 
407 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  52.72 
 
 
414 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  54.03 
 
 
393 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  53.26 
 
 
392 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  51.91 
 
 
393 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  52.37 
 
 
396 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  55.42 
 
 
406 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  55.42 
 
 
406 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  55.16 
 
 
406 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  54.21 
 
 
397 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  55.42 
 
 
406 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  52.53 
 
 
390 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  55.64 
 
 
395 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  53.44 
 
 
397 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  52.28 
 
 
393 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  51.15 
 
 
393 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  51.72 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  51.78 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  53.16 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  55.42 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  51.11 
 
 
416 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  52.03 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  51.65 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  55.16 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  52.03 
 
 
394 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  51.52 
 
 
396 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3539  HI0933 family protein  54.21 
 
 
402 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  52.28 
 
 
394 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  52.03 
 
 
394 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  51.78 
 
 
394 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  51.52 
 
 
394 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>