53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2523 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  756    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  62.82 
 
 
356 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  64.81 
 
 
350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  66.96 
 
 
354 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  61.7 
 
 
344 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  60 
 
 
352 aa  428  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  58.55 
 
 
353 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  56.89 
 
 
343 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  56.1 
 
 
345 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  49.85 
 
 
347 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  49.11 
 
 
346 aa  331  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  46.39 
 
 
345 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  39.58 
 
 
349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  39.17 
 
 
355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  41.77 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  34.83 
 
 
344 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  36.55 
 
 
344 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  34.73 
 
 
348 aa  215  9e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  34.85 
 
 
348 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.33 
 
 
344 aa  208  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.63 
 
 
344 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  31.71 
 
 
342 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  31.02 
 
 
368 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  30.29 
 
 
471 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  29.77 
 
 
349 aa  165  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  25.49 
 
 
355 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  27.22 
 
 
357 aa  126  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  25.51 
 
 
370 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  21.95 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  24.33 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  21.04 
 
 
346 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  25.29 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  21.94 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  23.29 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  22.26 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  20.83 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  20.92 
 
 
331 aa  53.1  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  27.03 
 
 
341 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  20.39 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  20.83 
 
 
360 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2169  hypothetical protein  20.67 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.764152  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2715  hypothetical protein  24.5 
 
 
238 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  18.44 
 
 
366 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  18.44 
 
 
366 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  22.51 
 
 
335 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  25 
 
 
370 aa  46.6  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  20.72 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  22.54 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  24.86 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3791  hypothetical protein  25 
 
 
390 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.325432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2236  hypothetical protein  21.5 
 
 
325 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  21.11 
 
 
342 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  21.83 
 
 
354 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>