More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2462 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  100 
 
 		 371 aa  742    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  53.04 
 
 		 358 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  53.82 
 
 		 356 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  31.32 
 
 		 489 aa  146  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  38.83 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.77 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  35.91 
 
 		 342 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  35.45 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  42.05 
 
 		 554 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  42.02 
 
 		 386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  39.2 
 
 		 523 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  40.56 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  41.3 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  37.57 
 
 		 541 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  36.1 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  36.7 
 
 		 547 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  37.43 
 
 		 541 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  36.55 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  36.96 
 
 		 519 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  31.78 
 
 		 513 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  37.62 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  39.87 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  39.6 
 
 		 528 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  39.02 
 
 		 303 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  32.99 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  35.14 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  46.09 
 
 		 226 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  35.35 
 
 		 219 aa  96.3  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  39.13 
 
 		 303 aa  96.3  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  37.02 
 
 		 235 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  37.02 
 
 		 235 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  38.24 
 
 		 520 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  37.65 
 
 		 525 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  37.09 
 
 		 228 aa  94  4e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  43.92 
 
 		 302 aa  93.2  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  32.99 
 
 		 267 aa  93.2  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  38.24 
 
 		 224 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  36.06 
 
 		 283 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  37.65 
 
 		 520 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  35.2 
 
 		 271 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1683  rhomboid family protein  37.37 
 
 		 248 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  38.59 
 
 		 279 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  30.59 
 
 		 227 aa  90.9  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  34.71 
 
 		 511 aa  90.5  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  41.38 
 
 		 268 aa  90.1  6e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  32.38 
 
 		 236 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 289 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  35.29 
 
 		 289 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  35.29 
 
 		 289 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  37.97 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  32.02 
 
 		 303 aa  87  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  33.68 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  35.59 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  36.81 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  28.76 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00270  uncharacterized membrane protein  33.84 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.361521  normal  0.0722571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  33.17 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  35.62 
 
 		 275 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  37.17 
 
 		 286 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1073  hypothetical protein  34.44 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.44354e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  35.08 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  31.43 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1764  Rhomboid family protein  38.03 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  36.36 
 
 		 579 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  38.1 
 
 		 747 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  34.16 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  35 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  38.73 
 
 		 625 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  34.75 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  41.89 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  37.76 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  31.32 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  53.33 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  40.54 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  41.22 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0207  Rhomboid family protein  30.98 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  34.57 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  34.16 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5244  Rhomboid family protein  42.55 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159225  hitchhiker  0.00568338 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  30.98 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  33.69 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  37.32 
 
 		 625 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.32 
 
 		 625 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  37.32 
 
 		 625 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  37.62 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  48.86 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  31.75 
 
 		 570 aa  73.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  30 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  37.62 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  34.76 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6351  Rhomboid family protein  33.99 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32 
 
 		 283 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  34.76 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  36.18 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  37.06 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0018  rhomboid family protein  43.62 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  39.47 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  31.03 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>