More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2458 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0419  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0597  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0838  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1298  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.618797  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1525  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.742906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1643  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1645  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1687  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2027  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2347  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00020548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2458  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2606  transposase IS4  100 
 
 
115 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1319  transposase IS4  100 
 
 
113 aa  235  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0807  transposase  71.43 
 
 
112 aa  176  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1594  transposase  71.43 
 
 
112 aa  176  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2135  transposase  71.43 
 
 
112 aa  176  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3262  transposase  71.43 
 
 
112 aa  176  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0407  transposase, IS4  69.3 
 
 
116 aa  175  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.789806  normal  0.45974 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  70.18 
 
 
131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0535  IS5 family transposase orfB  67.27 
 
 
146 aa  161  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0506  IS4 family transposase  58.77 
 
 
129 aa  150  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1528  IS4 family transposase  58.77 
 
 
129 aa  150  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2758  IS4 family transposase  58.77 
 
 
129 aa  150  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4638  transposase IS4 family protein  59.65 
 
 
129 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4650  transposase IS4 family protein  59.65 
 
 
129 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5032  IS4 family transposase  58.77 
 
 
129 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.137379  normal  0.729645 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5037  IS4 family transposase  58.77 
 
 
129 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.505561  normal  0.915342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  58.77 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  58.77 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  58.77 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3758  transposase IS4 family protein  57.89 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0586009  normal  0.260182 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4034  transposase IS4 family protein  57.89 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492844  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1006  transposase, IS4 family protein  58.77 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.733901  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1327  transposase, IS4 family protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175313  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0877  transposase, IS4 family protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0937  transposase, IS4 family protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.119126  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2823  transposase, IS4 family protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  59.46 
 
 
190 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 
336 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2133  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4093  transposase IS4 family protein  57.89 
 
 
129 aa  144  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.550334  normal  0.402512 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3823  hypothetical protein  58.93 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.375839  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0829  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4294  hypothetical protein  58.93 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4300  hypothetical protein  58.93 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0173  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4288  hypothetical protein  58.93 
 
 
129 aa  144  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0861  transposase, IS4 family protein  58.56 
 
 
190 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3540  hypothetical protein  58.04 
 
 
129 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.718907 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0168  transposase, IS4 family protein  61.68 
 
 
201 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3532  hypothetical protein  58.04 
 
 
129 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00922044  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0531  IS5 family transposase orfB  66.3 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00392831  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1839  transposase, IS4 family protein  61.4 
 
 
206 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.181674  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4122  hypothetical protein  61.4 
 
 
206 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0174  IS4 family transposase  58.77 
 
 
129 aa  133  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2296  transposase  55.05 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4160  response regulator receiver protein  56.36 
 
 
110 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2772  hypothetical protein  70.67 
 
 
106 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0317  hypothetical protein  58.25 
 
 
107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384563  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  46.49 
 
 
251 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  46.49 
 
 
251 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  49.11 
 
 
167 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  49.11 
 
 
252 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  49.11 
 
 
252 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.11 
 
 
252 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  49.11 
 
 
252 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  46.02 
 
 
260 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4349  putative transposase  44.86 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.715691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1589  hypothetical protein  44.86 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171898  normal  0.419285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2809  putative transposase  44.86 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0006  putative transposase  44.86 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2661  putative transposase  44.86 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.225009  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  44.95 
 
 
260 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5015  IS4 family transposase  39.81 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0619203 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  44.95 
 
 
260 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  44.95 
 
 
260 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  44.95 
 
 
260 aa  89.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6121  putative transposase  48.84 
 
 
86 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  39.29 
 
 
113 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  39.29 
 
 
113 aa  87  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  42.59 
 
 
266 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  38.6 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  40.37 
 
 
113 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  39.29 
 
 
113 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  42.2 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.17 
 
 
251 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  41.28 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  41.28 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  41.28 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  41.28 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3060  hypothetical protein  39.81 
 
 
119 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  40.54 
 
 
113 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3697  IS66 Orf2 family protein  53.52 
 
 
100 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>