More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2417 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
244 aa  509  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2087  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.72 
 
 
425 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.417065  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2171  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.79 
 
 
238 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0944598  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1443  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.79 
 
 
238 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0542  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.79 
 
 
238 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0444  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.79 
 
 
238 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.853961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0854  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.79 
 
 
238 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777865  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1863  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.3 
 
 
394 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00465528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3898  transcriptional regulator LasR  39.07 
 
 
239 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.219668  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0965  transcriptional activator protein LuxR  33.74 
 
 
248 aa  151  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.266935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45960  transcriptional regulator LasR  38.14 
 
 
239 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  34.65 
 
 
253 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4277  transcriptional regulator, LuxR family  33.19 
 
 
234 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.343912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1664  transcriptional regulator, LuxR family  32.92 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.888844 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1997  autoinducer-binding transcriptional regulator, LuxR family  32.92 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3098  transcriptional regulator, LuxR family  33.74 
 
 
254 aa  131  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521704  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3287  transcriptional activator SOLR transcription regulator protein  35.19 
 
 
236 aa  131  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.840181  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01929  transcriptional activator of quorum sensing autoinducer synthesis transcription regulator protein  35.85 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.746701 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2729  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0930619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0641  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0312274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2798  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.675669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2915  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.454836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2672  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1686  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0643903  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2371  ATP-dependent transcription regulator LuxR  36.44 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.440892  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0958  transcriptional activator protein LuxR  35.16 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1223  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1345  N-acyl homoserine lactone transcriptional regulator  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0962  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2485  BpsR  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1295  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312538  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0607  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83559  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1510  ATP-dependent transcription regulator LuxR  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.08907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0329  autoinducer-binding transcriptional regulator BpsR  33.63 
 
 
239 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1817  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.59 
 
 
241 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.985291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1052  LuxR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000445716  normal  0.182523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 
235 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5576  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000012464  normal  0.015154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3643  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00106494  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4724  LuxR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000522863  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0359  LuxR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.870907  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3971  LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
239 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000126265  normal  0.0321799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3395  LuxR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
260 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  36.8 
 
 
237 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 
237 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4116  LuxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
239 aa  121  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0201758  hitchhiker  0.00877352 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5810  LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.809704  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4581  LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000141763  hitchhiker  0.0000089809 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6040  LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.917081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0323  transcriptional regulator, LuxR family  33.47 
 
 
243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5699  LuxR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0607724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3810  LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0805  LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.565309  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2024  ATP-dependent transcription regulator LuxR  35.68 
 
 
230 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.896026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1576  LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
230 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0617  LuxR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
230 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0241474  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2128  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  35.68 
 
 
230 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.423434  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0702  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  35.68 
 
 
230 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.669136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2215  autoinducer-binding transcriptional regulator BmpR  35.68 
 
 
230 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3796  LuxR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
237 aa  111  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00301827 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0963  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.27907  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4299  LuxR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
237 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4980  LuxR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
237 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3180  LuxR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
237 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.100011 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0720  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0182  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00268604  hitchhiker  0.00000585836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4279  LuxR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189781  normal  0.0123236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0791  LuxR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5910  LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
237 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0531603  decreased coverage  0.00148471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1649  transcriptional regulator RhlR  31.02 
 
 
224 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.458186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19120  transcriptional regulator RhlR  31.02 
 
 
241 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.420854  normal  0.170234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4114  putative transcriptional activator  32.11 
 
 
213 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5725  DNA-binding HTH domain-containing protein  27.6 
 
 
307 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000726612  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0418  LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
242 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0402  regulatory protein, LuxR  38.1 
 
 
242 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0190  LuxR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
235 aa  105  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.195449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1758  autoinducer-binding domain-containing protein  34.03 
 
 
233 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0122  LuxR family transcriptional regulator  34.03 
 
 
233 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1513  LuxR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
246 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493267  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0198  autoinducer-binding domain-containing protein  29.61 
 
 
235 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00000129067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1836  transcriptional regulator, LuxR family  29.5 
 
 
245 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.28867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3863  transcriptional regulator PsyR  30.81 
 
 
247 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.831721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0183  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
235 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0816251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1231  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.09 
 
 
234 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.681253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3112  regulatory protein, LuxR  29.88 
 
 
250 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1622  LuxR transcriptional regulator  30.92 
 
 
247 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831315  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1709  autoinducer-binding domain-containing protein  34.38 
 
 
233 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.781724  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1003  transcriptional regulator, LuxR family  33.16 
 
 
245 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383688  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0627  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
241 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.253164  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0142  N-acyl-homoserine lactone dependent regulatory protein  28.76 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1570  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.76 
 
 
236 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.778317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5762  LuxR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
242 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.225342  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1652  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.76 
 
 
234 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.643432  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
243 aa  99  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4558  LuxR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
234 aa  98.6  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0100  transcriptional regulator, LuxR family  31.98 
 
 
250 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>