170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2372 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2372  ApaG  100 
 
 		 127 aa  259  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2231  ApaG  70.08 
 
 		 127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.340232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3484  ApaG  59.84 
 
 		 127 aa  173  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.526547  normal  0.166283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2722  ApaG domain protein  62.9 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2878  ApaG  63.11 
 
 		 124 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2636  ApaG  56.69 
 
 		 127 aa  167  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0464  ApaG  62.3 
 
 		 124 aa  166  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3493  ApaG  62.3 
 
 		 124 aa  166  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00288381  decreased coverage  0.0000301407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3020  ApaG  63.93 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.737478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3175  ApaG  62.6 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2857  ApaG  60.66 
 
 		 124 aa  163  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.93069  normal  0.818828 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2755  ApaG  63.64 
 
 		 124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.263263  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0536  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.680201  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0466  ApaG  59.84 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.357414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2906  ApaG  59.84 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3120  ApaG  63.64 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802006  normal  0.119699 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0442  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0641  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0937  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3552  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.144794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3579  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1907  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3624  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2568  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0537  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3571  ApaG  59.84 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2695  ApaG  59.02 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2335  ApaG  59.35 
 
 		 126 aa  160  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0509  ApaG  59.84 
 
 		 124 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0222  ApaG  60.8 
 
 		 128 aa  158  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1346  ApaG  58.27 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.637296  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0735  ApaG  58.2 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07710  ApaG  58.2 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0202441 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1982  ApaG domain protein  57.6 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.78252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46840  ApaG  59.84 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0400  ApaG  57.38 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4802  ApaG  55.74 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0434  ApaG  57.38 
 
 		 126 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0431  ApaG  57.38 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.425394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0550  apaG protein  55.74 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4628  ApaG  55.74 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0150  ApaG  53.66 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0164  ApaG  52.85 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.703501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3413  ApaG  52.76 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4014  ApaG  55.74 
 
 		 126 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1050  ApaG  55.28 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0328783  normal  0.737772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3900  ApaG domain-containing protein  54.62 
 
 		 128 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3661  ApaG  53.49 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0437  ApaG  56.52 
 
 		 136 aa  140  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.30268 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2738  apaG protein  50.39 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5136  ApaG  54.1 
 
 		 126 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2359  ApaG domain protein  50.39 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.000000000770969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0493  ApaG  52.38 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0349  ApaG  56.52 
 
 		 135 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.093684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0531  ApaG  54.78 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4467  ApaG  51.54 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0420  ApaG domain protein  54.78 
 
 		 211 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.416529 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0586  ApaG  54.78 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.12497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04646  ApaG  50.39 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0721  ApaG  53.98 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1279  ApaG domain protein  53.91 
 
 		 142 aa  132  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.638394  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1289  ApaG  49.61 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1353  ApaG  49.61 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.214186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2820  ApaG  54.62 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.841755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0736  ApaG  50.41 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0360  ApaG  59.62 
 
 		 137 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0861  ApaG  51.26 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0667  ApaG  48.03 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0241  ApaG  53.66 
 
 		 126 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3468  ApaG  50 
 
 		 124 aa  127  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0189  ApaG  53.33 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.57181  normal  0.332972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6540  ApaG  46.92 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.560513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0764  ApaG  50 
 
 		 131 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  hitchhiker  0.00575768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001666  ApaG protein  49.58 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0179  ApaG  51.67 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386018  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00054  hypothetical protein  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3549  ApaG domain protein  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0044  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.271562  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3605  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118033 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0054  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.496379 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0056  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0054  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00391573  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00053  hypothetical protein  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.456951  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0056  ApaG  46.22 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0915002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3422  ApaG  48.72 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687346  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0898  ApaG  50 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1197  ApaG  51.38 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1015  ApaG domain protein  47.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7451  ApaG  46.92 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953585  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0787  ApaG  49.14 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  0.0936673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5255  ApaG  50.43 
 
 		 130 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1039  ApaG domain-containing protein  48.28 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0988  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233116  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03415  ApaG  46.67 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0904  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.764534  normal  0.43881 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3080  ApaG  50.42 
 
 		 126 aa  120  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3116  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2312  ApaG  46.92 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.661489  normal  0.04269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4173  ApaG  50.42 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00807  ApaG  47.9 
 
 		 126 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>