92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2356 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  100 
 
 
145 aa  295  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0643  TadE-like protein  54.86 
 
 
152 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155901  normal  0.589277 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6000  TadE family protein  55.3 
 
 
147 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6296  TadE family protein  53.28 
 
 
147 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  55.32 
 
 
153 aa  148  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  55.32 
 
 
153 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  55.32 
 
 
153 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  54.17 
 
 
153 aa  146  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  54.2 
 
 
147 aa  139  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6780  TadE family protein  54.74 
 
 
147 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0136653  normal  0.216151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5494  TadE-like  54.74 
 
 
147 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0094498  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6368  TadE family protein  54.74 
 
 
147 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.455628  normal  0.902056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  55.56 
 
 
147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2653  TadE-like  45.77 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  43.07 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1526  TadE family protein  40.69 
 
 
149 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2368  hypothetical protein  37.91 
 
 
152 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.274749  normal  0.12275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2017  TadE family protein  36.49 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2553  TadE-like  34.94 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.429285  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  38.1 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0584  TadE family protein  35.29 
 
 
165 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.45278 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6295  TadE family protein  45.76 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5999  TadE family protein  45.76 
 
 
177 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.835378  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  33.33 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  37.89 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  68.42 
 
 
189 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0644  TadE-like protein  42.86 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262205  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7198  TadE-like protein  45.76 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6369  TadE family protein  44.07 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.944894 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6781  TadE family protein  44.07 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179995  normal  0.123574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1037  TadE family protein  37.89 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5495  TadE-like  44.07 
 
 
177 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0437869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2669  TadE family protein  28.12 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.380149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2654  TadE-like  43.75 
 
 
163 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  32.38 
 
 
209 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  31.71 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2552  TadE-like  35.94 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.442336  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2271  hypothetical protein  45.65 
 
 
180 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.58997  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  33.04 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  44.44 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3088  TadE family protein  42.86 
 
 
180 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  31.5 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  42.62 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2064  TadE family protein  51.02 
 
 
180 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1313  hypothetical protein  42.86 
 
 
722 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  53.06 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  29.36 
 
 
177 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4863  TadE family protein  52.5 
 
 
176 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.873182  normal  0.592097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  45.83 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2734  TadE family protein  30.39 
 
 
145 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  41.18 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  48.89 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3787  TadE family protein  29.03 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.326508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  42.86 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2963  TadE family protein  45.45 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  39.29 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  41.18 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  41.18 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  42.86 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  42.86 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  42.86 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  42.86 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  29.17 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  42.86 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  48.08 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  45.83 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2328  TadE family protein  42.31 
 
 
165 aa  41.6  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  43.75 
 
 
175 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2357  TadE-like  53.33 
 
 
185 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2051  TadE family protein  34.31 
 
 
138 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  42.86 
 
 
157 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  38 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  42.86 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4787  TadE family protein  47.5 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0894541 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  39.34 
 
 
156 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  34.51 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  44.64 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2707  hypothetical protein  42.31 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0242246  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2979  TadE family protein  51.11 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.565084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  39.62 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  27.66 
 
 
162 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  38.78 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2016  TadE family protein  34.92 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.631839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0638  TadE-like  25.86 
 
 
146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2369  hypothetical protein  32.69 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266179  normal  0.186835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  47.83 
 
 
181 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  32.24 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  43.75 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1644  TadE-like protein  27.78 
 
 
160 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000291587  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  44.9 
 
 
176 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>