105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2249 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  65.67 
 
 
71 aa  99.8  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  65.22 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  66.67 
 
 
70 aa  91.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  57.58 
 
 
71 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  63.24 
 
 
70 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  64.18 
 
 
70 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1790  hypothetical protein  56.06 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0307  hypothetical protein  56.06 
 
 
69 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  54.55 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  42.65 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  43.94 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  41.94 
 
 
74 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2364  protein of unknown function DUF1458  47.69 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  42.42 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  41.79 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  38.81 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  39.39 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  37.88 
 
 
70 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  41.27 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  37.88 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  40.58 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  37.88 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  40 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  39.71 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1560  hypothetical protein  36.51 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  40.68 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  37.88 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  37.88 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  37.88 
 
 
69 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  37.88 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  33.82 
 
 
73 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  40.3 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  37.7 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  40.62 
 
 
70 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0155  hypothetical protein  37.31 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.275078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  37.31 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4704  hypothetical protein  43.08 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  34.85 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  39.34 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  34.33 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2854  hypothetical protein  41.54 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  37.88 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  37.88 
 
 
69 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  32.31 
 
 
69 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0625  hypothetical protein  33.9 
 
 
64 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0037  hypothetical protein  35.82 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0100  hypothetical protein  32.86 
 
 
71 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2075  hypothetical protein  31.82 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381889  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  38.1 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 
67 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0772  protein of unknown function DUF1458  34.85 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0020  protein of unknown function DUF1458  39.06 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  31.82 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  34.33 
 
 
71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0268  hypothetical protein  33.33 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  40.3 
 
 
71 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01085  hypothetical protein  33.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.300866  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  37.29 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  38.46 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  38.46 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  31.82 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  31.82 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  34.33 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1493  hypothetical protein  32.2 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1015  hypothetical protein  31.43 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.687737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0104  hypothetical protein  34.33 
 
 
71 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3624  hypothetical protein  37.1 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178582  normal  0.0835288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2980  hypothetical protein  35 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  35 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  37.31 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  29.69 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  35.48 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  28.79 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2011  hypothetical protein  35.59 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0829  hypothetical protein  29.69 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  30.3 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  39.39 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1866  protein of unknown function DUF1458  37.5 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  29.69 
 
 
69 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  35.38 
 
 
69 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0101  hypothetical protein  31.34 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000474292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  29.69 
 
 
69 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3647  hypothetical protein  29.69 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  28.81 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2626  hypothetical protein  35.82 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.679626  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2317  protein of unknown function DUF1458  34.38 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0033  protein of unknown function DUF1458  42.62 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1942  hypothetical protein  34.38 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00110853  normal  0.953866 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>