More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2222 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  55 
 
 
265 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  55.17 
 
 
105 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  57.83 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  57.83 
 
 
99 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  54.12 
 
 
89 aa  91.3  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.59 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.59 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1771  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  45.45 
 
 
99 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.219727  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  53.66 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  53.66 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  52.44 
 
 
79 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0940  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  50.55 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.705703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  56.45 
 
 
279 aa  77.4  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  57.38 
 
 
227 aa  77  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2087  comE operon protein 1, putative  55.56 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2375  putative comE operon protein 1  57.38 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2372  putative DNA uptake protein, ComEA-like  46.94 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170687  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  53.45 
 
 
206 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0781  competence protein CelA  44.78 
 
 
217 aa  73.6  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.918663  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0570  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  55.88 
 
 
224 aa  73.6  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000494468  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3189  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  54.1 
 
 
286 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0624  hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1407  hypothetical protein  52.17 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1508  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  58.93 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0230  acetohydroxy acid synthase large subunit  52.17 
 
 
115 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  57.58 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  53.97 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  52.46 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2476  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  57.38 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2544  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  57.38 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.644466  normal  0.0231779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  60.71 
 
 
190 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1612  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  56.9 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1548  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  48 
 
 
89 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1737  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  54.1 
 
 
290 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1623  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  56.9 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1646  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  56.9 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.330475  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2731  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  56.9 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0259304 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2642  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  57.38 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  53.97 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  56.67 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  52.46 
 
 
225 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1813  DNA-binding protein, putative  57.38 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1375  hypothetical protein  50 
 
 
321 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.737555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2803  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  59.02 
 
 
277 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1741  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  61.54 
 
 
184 aa  70.1  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1136  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.381849  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0032  hypothetical protein  50 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0867768  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2387  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2207  hypothetical protein  50 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  56.45 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2259  putative comE protein  50 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.235936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2221  putative comE protein  50 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1865  hypothetical protein  50 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5146  hypothetical protein  50 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2104  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  49.18 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.854635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1869  hypothetical protein  45.56 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391692  hitchhiker  0.000308285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  44.78 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6234  hypothetical protein  48.89 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.815006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1428  hypothetical protein  47.87 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  decreased coverage  0.00108668 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1521  late competence protein required for DNA binding and uptake  47.54 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1845  hypothetical protein  48.89 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311424  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1755  hypothetical protein  46.81 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0329  DNA uptake protein  46.27 
 
 
234 aa  67.8  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  55.74 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3525  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  47.06 
 
 
267 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4167  DNA-binding protein  39.42 
 
 
113 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1000  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  54.1 
 
 
207 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  47.06 
 
 
267 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1783  hypothetical protein  46.53 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948816  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1428  hypothetical protein  48.81 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3593  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  47.06 
 
 
267 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13270  DNA uptake protein  50 
 
 
301 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0575  hypothetical protein  41.86 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1013  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.86 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192712  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1054  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.86 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0753  hypothetical protein  43.21 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  42.65 
 
 
587 aa  67  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  54.1 
 
 
105 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004039  DNA uptake protein  44.71 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2211  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  55.74 
 
 
320 aa  67  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0558  Fis family transcriptional regulator  45.12 
 
 
99 aa  67  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340752  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  50.82 
 
 
204 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1230  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  52.46 
 
 
296 aa  67  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.890666  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0773  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  49.18 
 
 
250 aa  66.6  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.466163  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  50.82 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1691  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  45.59 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.176877  unclonable  0.000000000719685 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0113  putative competence DNA binding protein ComEA  52.31 
 
 
115 aa  65.5  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.203684  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2562  hypothetical protein  42.5 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  49.18 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50.85 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  49.18 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  55 
 
 
545 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1815  putative DNA uptake protein, ComEA-like protein  48.75 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1944  DNA uptake protein related DNA-binding protein  50.82 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.727384  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  50 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  55 
 
 
545 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0462  ComE operon protein 1  50.79 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1507  hypothetical protein  60 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.24688e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1886  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  50.82 
 
 
300 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.528332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>