29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2160 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2160  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  181  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.419766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1800  Cro/CI family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0963  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000305628 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1995  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000194045  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1184  transcriptional regulator, XRE family  46.77 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2316  Cro/CI family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.723017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0014  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127273  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49660  hypothetical protein  37.68 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000595514  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0975  putative transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4807  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125806  hitchhiker  0.00510188 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0373  Cro/CI family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000821993  normal  0.249392 
 
 
 
NC_007520  Tcr_2123  hypothetical protein  39.68 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0684  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0251  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3657  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.544629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4286  Cro/CI family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0302  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.41457  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4458  putative transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3980  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2285  Cro/CI family transcription regulator  29.85 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5017  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2262  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 68 aa  42  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.914675  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6190  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876157  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71330  putative transcriptional regulator  33.87 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1665  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2358  hypothetical protein  35.19 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000081812  decreased coverage  0.0000157362 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0037  Transcriptional Regulator, XRE family  26.47 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0100  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>