More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2142 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  52.78 
 
 
205 aa  200  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 
202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  38.15 
 
 
179 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  37.43 
 
 
179 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 
194 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  38.42 
 
 
185 aa  138  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  38.15 
 
 
179 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  40.24 
 
 
194 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  36.99 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  36.99 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  36.99 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  36.99 
 
 
179 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  36.99 
 
 
179 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  36.31 
 
 
179 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  36.99 
 
 
179 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  35.98 
 
 
177 aa  121  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  36.36 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 
179 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  35.2 
 
 
185 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  31.46 
 
 
187 aa  105  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  32.74 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 
204 aa  81.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  27.42 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
172 aa  80.9  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  30.67 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  32.39 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  29.17 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  28.95 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  28.74 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  31.14 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  34.29 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  31.35 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2989  isochorismatase  26.6 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2178  isochorismatase  26.6 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00513339  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2336  isochorismatase  26.6 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2401  isochorismatase  26.6 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  39.39 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  39.39 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2207  isochorismatase  27.95 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2371  isochorismatase  27.95 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2471  isochorismatase  27.95 
 
 
295 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000432607  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1804  isochorismatase  31.48 
 
 
285 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.74 
 
 
233 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  30.51 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  24.19 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  33.81 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.32 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2146  isochorismatase  26.2 
 
 
295 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.315852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2389  isochorismatase  27.33 
 
 
295 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  36.46 
 
 
231 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2130  isochorismatase  26.2 
 
 
295 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 
239 aa  62  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.43 
 
 
227 aa  62  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  36.84 
 
 
247 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0464  Isochorismatase  26.44 
 
 
291 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  32.12 
 
 
233 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 
232 aa  61.6  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  35.35 
 
 
227 aa  61.6  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  28.07 
 
 
174 aa  61.6  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  29.1 
 
 
228 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  27.22 
 
 
189 aa  61.2  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
224 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2962  isochorismatase hydrolase  28.82 
 
 
172 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.419394  normal  0.652284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  35.96 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.68 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  28.21 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6174  isochorismatase hydrolase  44.74 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.122012 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  27.49 
 
 
174 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1242  isochorismatase family protein  29.83 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303599 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
184 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  39.02 
 
 
182 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3419  isochorismatase  28.68 
 
 
284 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000498734  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  39.19 
 
 
230 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  39.19 
 
 
231 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  39.19 
 
 
231 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  39.19 
 
 
230 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>