211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2095 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
245 aa  512  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  56.45 
 
 
256 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  52.57 
 
 
252 aa  255  4e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.5 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  56.31 
 
 
237 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  56.31 
 
 
288 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  48.19 
 
 
252 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  53.92 
 
 
282 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  55.09 
 
 
234 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  52.45 
 
 
288 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  50.49 
 
 
250 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.97 
 
 
309 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.62 
 
 
233 aa  131  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  41.51 
 
 
266 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.84 
 
 
236 aa  118  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  41.77 
 
 
238 aa  118  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.61 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  38.95 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.73 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.7 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.71 
 
 
244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.68 
 
 
237 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.5 
 
 
250 aa  106  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  33.67 
 
 
383 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  31.82 
 
 
377 aa  102  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  31.52 
 
 
294 aa  101  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 
318 aa  100  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.93 
 
 
238 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  33.51 
 
 
277 aa  98.6  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.51 
 
 
277 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  33.51 
 
 
277 aa  99  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  30.4 
 
 
327 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.59 
 
 
318 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.3 
 
 
277 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.19 
 
 
303 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.48 
 
 
304 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.86 
 
 
308 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  28.71 
 
 
376 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.71 
 
 
319 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.51 
 
 
311 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  30.53 
 
 
343 aa  92.4  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.78 
 
 
328 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.12 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.12 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.23 
 
 
331 aa  85.9  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.84 
 
 
343 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  36.8 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  28.86 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.22 
 
 
325 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  36.23 
 
 
277 aa  78.6  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.02 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.94 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.43 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.22 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.25 
 
 
271 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.07 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.92 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.77 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0474  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.51 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1119  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  36.29 
 
 
234 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00412306  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4059  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.55 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622543  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0643  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.64 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.599844  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3579  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  33.55 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195352  normal  0.218152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3889  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.65 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2501  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.68 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  34.72 
 
 
190 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4419  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.48 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35064  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0368  dioxygenase family protein  33.09 
 
 
224 aa  59.7  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  33.56 
 
 
190 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2775  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit(PcaH)  34.68 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000406236  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  35.29 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321116  normal  0.293575 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0981  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00626299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0394  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187163  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3345  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4195  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.348592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4172  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
235 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0245  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000128841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1845  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0795201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00117633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1351  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.68 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.010139  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1859  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.68 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0804  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.78 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0053  dioxygenase, putative  30.23 
 
 
213 aa  57  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.79 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0627  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.17 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.799522  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.26 
 
 
190 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1382  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.12 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.789862  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1441  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta oxidoreductase protein  32.14 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  32.71 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2326  protocatechuate 3,4-dioxygenase subunit beta  32.52 
 
 
235 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4656  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.57 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7609  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  34.78 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4518  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.57 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4651  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.57 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.93005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1538  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.03 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0431142  normal  0.14512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.52 
 
 
249 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00387688  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  29.87 
 
 
237 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3313  catechol 1,2-dioxygenase  33.97 
 
 
301 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0277035  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>