More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2083 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 554 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 		 562 aa  691    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 554 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1608  glutaminyl-tRNA synthetase  55.78 
 
 		 613 aa  656    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0558752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1419  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 569 aa  804    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 554 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 555 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2489  glutaminyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 		 628 aa  667    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.348207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  65.15 
 
 		 554 aa  739    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 567 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 		 560 aa  697    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  63.41 
 
 		 580 aa  724    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 580 aa  757    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 554 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1633  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 569 aa  804    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0234579  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  67.26 
 
 		 573 aa  805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 569 aa  805    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 569 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0892  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 569 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  68.39 
 
 		 569 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 551 aa  674    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 551 aa  674    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 579 aa  660    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  62.76 
 
 		 576 aa  752    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 564 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 567 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3447  glutaminyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 601 aa  719    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.183021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 609 aa  766    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1722  glutaminyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 590 aa  713    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 567 aa  679    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 565 aa  794    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 559 aa  667    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  60.83 
 
 		 561 aa  708    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 567 aa  681    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1812  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 596 aa  803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0624978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2300  glutaminyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 604 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.775495  hitchhiker  0.00472002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 		 566 aa  689    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 572 aa  738    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 		 556 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4549  glutaminyl-tRNA synthetase  68.21 
 
 		 569 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 554 aa  658    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  65.7 
 
 		 553 aa  747    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 555 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  61.34 
 
 		 568 aa  686    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  60.22 
 
 		 555 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1440  glutaminyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 590 aa  716    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  62.28 
 
 		 570 aa  722    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 565 aa  1177    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  58.8 
 
 		 555 aa  662    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  67.92 
 
 		 569 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1845  glutaminyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 559 aa  657    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0694  glutaminyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 		 580 aa  646    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.352024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 561 aa  693    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 		 556 aa  653    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  66.55 
 
 		 568 aa  765    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1823  glutaminyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 620 aa  667    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 554 aa  658    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 559 aa  678    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2082  glutaminyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 		 596 aa  761    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3350  glutaminyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 612 aa  679    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.446012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  68.39 
 
 		 569 aa  813    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0701  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 569 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1956  glutaminyl-tRNA synthetase  53.69 
 
 		 619 aa  666    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 		 561 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  68.39 
 
 		 569 aa  815    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 576 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  59.31 
 
 		 558 aa  674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 555 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 582 aa  772    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 555 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1910  glutaminyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 569 aa  813    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.474008 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0923  glutaminyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 569 aa  812    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  62.36 
 
 		 558 aa  733    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 582 aa  681    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 552 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 552 aa  643    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 555 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 553 aa  636    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0459  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 569 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.200352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 556 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4234  glutaminyl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 628 aa  645    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.512355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 555 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 565 aa  748    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1351  glutaminyl-tRNA synthetase  56.31 
 
 		 625 aa  677    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.22682 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 556 aa  656    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 589 aa  706    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  68.57 
 
 		 569 aa  817    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0613  glutaminyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 		 587 aa  642    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.794454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 556 aa  672    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  68.21 
 
 		 569 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1655  glutaminyl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 569 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.434975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 561 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 564 aa  722    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1314  glutaminyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 		 609 aa  683    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 		 556 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 		 565 aa  752    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 		 557 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  59.35 
 
 		 554 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  59.17 
 
 		 554 aa  657    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 563 aa  680    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>