172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2003 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  50.69 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  49.66 
 
 		 162 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  51.39 
 
 		 171 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  48.3 
 
 		 232 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  47.4 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  43.11 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  43.15 
 
 		 196 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  42.57 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  43.8 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  38.22 
 
 		 148 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  41.89 
 
 		 185 aa  111  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  39.35 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  44.29 
 
 		 153 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  42.86 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  44.85 
 
 		 153 aa  108  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  37.27 
 
 		 192 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.71 
 
 		 169 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  41.56 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  36.42 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  45 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.81 
 
 		 153 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  35.03 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  38.51 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  35.26 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.88 
 
 		 164 aa  98.6  7e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  35.8 
 
 		 175 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  41.3 
 
 		 191 aa  97.8  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  36.08 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  35.8 
 
 		 175 aa  97.1  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  36.91 
 
 		 185 aa  96.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  35.19 
 
 		 175 aa  96.3  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.33 
 
 		 182 aa  95.9  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  40.58 
 
 		 205 aa  95.9  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.89 
 
 		 175 aa  95.5  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  37.06 
 
 		 187 aa  95.5  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 171 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.58 
 
 		 187 aa  91.7  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.74 
 
 		 199 aa  91.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  37.82 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  32.94 
 
 		 183 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  37.5 
 
 		 150 aa  90.1  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.76 
 
 		 166 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  36.03 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  34.42 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.03 
 
 		 180 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  36.5 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  35.42 
 
 		 158 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1302  hypothetical protein  55.84 
 
 		 92 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.470443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  35.93 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  34.06 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  35.97 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  37.16 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  34.48 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  31.33 
 
 		 161 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  39.04 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.76 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.75 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  36.23 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.1 
 
 		 166 aa  77.4  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  35.33 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  33.12 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  29.37 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  35 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  38.62 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  30 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  35.37 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  30.28 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.07 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  29.58 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.58 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  31.1 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  32.33 
 
 		 136 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.46 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.9 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  29.37 
 
 		 214 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  35.95 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  27.91 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  28.12 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  26.54 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.18 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  33.09 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.06 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  31.82 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  30 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  31.06 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.68 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  29.82 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.87 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  29.19 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  28.03 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.06 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  29.19 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  28.98 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  28.57 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>