More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1981 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1981  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  746    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0175  protein of unknown function DUF140  55.65 
 
 
374 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0168  protein of unknown function DUF140  55.65 
 
 
374 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.710497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0313  hypothetical protein  55.98 
 
 
374 aa  378  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0072  hypothetical protein  52.66 
 
 
376 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6243  ABC transporter, inner membrane subunit  54.26 
 
 
374 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2910  hypothetical protein  53.41 
 
 
374 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2950  hypothetical protein  53.69 
 
 
374 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2901  hypothetical protein  53.09 
 
 
447 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371031  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2812  hypothetical protein  53.41 
 
 
374 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221535  normal  0.381774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0205  hypothetical protein  56.97 
 
 
379 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2277  protein of unknown function DUF140  52.46 
 
 
371 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1206  hypothetical protein  52.23 
 
 
368 aa  346  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.699357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0491  protein of unknown function DUF140  57.45 
 
 
377 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13825  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0101  hypothetical protein  54.57 
 
 
357 aa  342  9e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0403  hypothetical protein  53.37 
 
 
374 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00912945 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4225  ABC transporter inner membrane protein  57.63 
 
 
377 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.220227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0373  ABC transporter, permease protein  52.81 
 
 
404 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2286  hypothetical protein  50.84 
 
 
425 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3917  hypothetical protein  55.86 
 
 
376 aa  339  4e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.843162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0174  ABC transporter, permease protein, putative  53.39 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0431  putative ABC transporter, permease protein  52.86 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.238842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0612  ABC transporter, permease protein  52.86 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0230  hypothetical protein  52.16 
 
 
383 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0450  putative ABC transporter, permease protein  52.86 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0182  hypothetical protein  49.21 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1361  ABC transporter, permease protein  52.86 
 
 
428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0066  ABC transporter, permease protein  52.86 
 
 
355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0232  putative ABC transporter, permease protein  52.86 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3201  putative ABC transporter, permease protein  52.86 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0299  protein of unknown function DUF140  50.68 
 
 
388 aa  333  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.675312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0306  hypothetical protein  49.6 
 
 
375 aa  328  9e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45629  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2365  hypothetical protein  49.31 
 
 
373 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00138547  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0250  hypothetical protein  55.24 
 
 
372 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0365  hypothetical protein  50.84 
 
 
376 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0244  protein of unknown function DUF140  54.96 
 
 
372 aa  315  9e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0920  hypothetical protein  52.68 
 
 
374 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0648  ABC transporter, permease protein, putative  47.35 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0798  protein of unknown function DUF140  47.35 
 
 
378 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.737521  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1681  hypothetical protein  37.5 
 
 
383 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  37.96 
 
 
377 aa  210  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  39.16 
 
 
413 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  35.76 
 
 
373 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  39.86 
 
 
364 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2845  hypothetical protein  33.61 
 
 
372 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  36.67 
 
 
377 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0117  putative ABC transporter, permease protein (DUF140 domain protein)  33.15 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.591838  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1637  ABC transporter, permease protein, putative  33.63 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1818  ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
369 aa  197  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2006  ABC transporter permease  33.63 
 
 
369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1433  stas domain-containing protein  32.87 
 
 
368 aa  193  5e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102521  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  33.16 
 
 
406 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0102  protein of unknown function DUF140  35.56 
 
 
376 aa  191  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  33.43 
 
 
368 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5005  hypothetical protein  34.62 
 
 
344 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238199  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1154  protein of unknown function DUF140  35.84 
 
 
385 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.201418  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0577  ABC transport system permease  29.67 
 
 
367 aa  184  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  33.81 
 
 
388 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2030  hypothetical protein  32.66 
 
 
374 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2025  hypothetical protein  33.13 
 
 
374 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  35.09 
 
 
365 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5750  putative ABC transporter (permease protein)  39.19 
 
 
378 aa  182  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0092  MTA/SAH nucleosidase  32.51 
 
 
368 aa  181  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0905172  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4485  protein of unknown function DUF140  34.19 
 
 
383 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  33.03 
 
 
380 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1636  hypothetical protein  35.16 
 
 
383 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3564  hypothetical protein  33.97 
 
 
371 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.777285  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1505  protein of unknown function DUF140  32.47 
 
 
430 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1627  hypothetical protein  34.01 
 
 
383 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.908289  normal  0.63791 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1452  hypothetical protein  35.45 
 
 
377 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  32.45 
 
 
378 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2317  hypothetical protein  33.13 
 
 
364 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.1978  normal  0.392221 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  31.95 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4717  protein of unknown function DUF140  40.53 
 
 
382 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1315  hypothetical protein  33.81 
 
 
377 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  34.45 
 
 
382 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2512  hypothetical protein  32.3 
 
 
387 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0475648 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1720  hypothetical protein  40.25 
 
 
366 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.176851  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4043  hypothetical protein  37.98 
 
 
378 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2809  ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
366 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.59078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1952  hypothetical protein  35.98 
 
 
384 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0257894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2195  protein of unknown function DUF140  32.52 
 
 
394 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130725  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0817  protein of unknown function DUF140  33.69 
 
 
382 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000758551  normal  0.202009 
 
 
-
 
NC_004310  BR1019  toulene ABC transporter, permease protein, putative  34.33 
 
 
391 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0524  protein of unknown function DUF140  31.87 
 
 
373 aa  168  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.830766  normal  0.234341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2050  hypothetical protein  33.42 
 
 
384 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.449343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1489  hypothetical protein  39.42 
 
 
366 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.453578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0158  hypothetical protein  33.33 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0891  hypothetical protein  33.15 
 
 
382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.250825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0851  protein of unknown function DUF140  33.06 
 
 
381 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0177985 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4625  hypothetical protein  33.98 
 
 
376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.306336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  32.25 
 
 
382 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0986  putative toulene ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0579  hypothetical protein  30.88 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0199346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0628  ABC transporter permease  30.88 
 
 
372 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000296062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  33.03 
 
 
376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  33.13 
 
 
370 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0142  hypothetical protein  33.64 
 
 
377 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  33.61 
 
 
384 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>