51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1955 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1955  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1149  hypothetical protein  57.72 
 
 
153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  44.44 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0570  hypothetical protein  51.49 
 
 
134 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0058  hypothetical protein  36.76 
 
 
139 aa  105  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3229  hypothetical protein  43.75 
 
 
146 aa  105  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  41.8 
 
 
137 aa  100  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  40.98 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00063  hypothetical protein  36.22 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0950  hypothetical protein  52.56 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000580743  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3646  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.29 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.432193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.31 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  28.81 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  31.21 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  32.48 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  32.67 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.43 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  30.28 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  30.22 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  26.5 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4120  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0525047  normal  0.115459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  30.39 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  30.48 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  31.68 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3761  hypothetical protein  26.24 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  27.59 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  30.69 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2871  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0483  hypothetical protein  27.03 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0582  hypothetical protein  23.88 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00151271  hitchhiker  0.00238722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  34.09 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1305  hypothetical protein  27.89 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  36.92 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2333  hypothetical protein  30.86 
 
 
131 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0104783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2582  hypothetical protein  29.47 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4111  hypothetical protein  22.22 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3097  hypothetical protein  27.68 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2821  hypothetical protein  43.4 
 
 
134 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  43.64 
 
 
142 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4113  hypothetical protein  25.49 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  44.44 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0431  hypothetical protein  21.97 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3366  hypothetical protein  28.04 
 
 
140 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.745172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4109  hypothetical protein  21.67 
 
 
139 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1598  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  35.85 
 
 
132 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000483764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2857  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  22.64 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>