99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1769 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  100 
 
 
207 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  49.51 
 
 
207 aa  220  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  41.06 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  42.05 
 
 
200 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  41.55 
 
 
212 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  41.83 
 
 
210 aa  164  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  42.57 
 
 
210 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  42.86 
 
 
221 aa  158  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  41.06 
 
 
210 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 
210 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  41.87 
 
 
210 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 
199 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 
221 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  38.28 
 
 
221 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 
221 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 
210 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  33.99 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  39.8 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  31.34 
 
 
242 aa  121  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  30.92 
 
 
238 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  34.15 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  34.69 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  30.61 
 
 
200 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  34.47 
 
 
210 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  32.84 
 
 
210 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  30.33 
 
 
244 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  26.96 
 
 
242 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  28.43 
 
 
206 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  30.15 
 
 
212 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  28.72 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  27.94 
 
 
208 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  32.8 
 
 
245 aa  88.6  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  35.23 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  30.85 
 
 
233 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  26.98 
 
 
207 aa  85.1  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  30.95 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  25.54 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  27.17 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  25.94 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  26.29 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  31.9 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  27.09 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  25.36 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  27.83 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 
305 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  25.12 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  26.32 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  28.57 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  24.18 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  33.79 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  24.04 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  27.93 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  24.63 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  28.24 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  28.96 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  28.65 
 
 
214 aa  72  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  27.6 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  28.42 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  30.27 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  28.8 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  22.53 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  29.61 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  26.56 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  25.37 
 
 
297 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  23.59 
 
 
297 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6472  hypothetical protein  27.07 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  28.67 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  23.44 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  27.12 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  25.27 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  26.98 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  26.98 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  26.98 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  25.67 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  24.86 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  25.23 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  24.65 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.29 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  24.65 
 
 
230 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  28.92 
 
 
249 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  31.78 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  28.92 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  28.92 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  28.92 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  28.92 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  28.92 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  28.92 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  25.73 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  28.41 
 
 
217 aa  52  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  22.17 
 
 
224 aa  51.2  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  22.17 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1155  putative protein-disulfide isomerase  21.43 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.400146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1089  putative protein-disulfide isomerase  21.05 
 
 
217 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2477  DSBA oxidoreductase  23.9 
 
 
206 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.494112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2247  DSBA oxidoreductase  25.38 
 
 
210 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281612  normal  0.141895 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  23.37 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 
215 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3208  DSBA oxidoreductase  26.72 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0193  hypothetical protein  25.93 
 
 
195 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>