37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1766 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1766  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  790    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00135853  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2228  aminoglycoside phosphotransferase  32.66 
 
 
380 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276157  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4117  hypothetical protein  32.73 
 
 
382 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2011  aminoglycoside phosphotransferase  32.93 
 
 
378 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2057  aminoglycoside phosphotransferase  32.93 
 
 
378 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1992  hypothetical protein  32.52 
 
 
378 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4018  hypothetical protein  27.79 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.41342  normal  0.763019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2018  hypothetical protein  26.27 
 
 
398 aa  96.3  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135716  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0329  hypothetical protein  28.62 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0029643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3833  hypothetical protein  28.09 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0625  hypothetical protein  31.05 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3907  hypothetical protein  28.09 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3819  hypothetical protein  28.09 
 
 
357 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0979  hypothetical protein  25.76 
 
 
358 aa  81.3  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0367  aminoglycoside phosphotransferase  26.11 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2429  hypothetical protein  27.38 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0125007  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4223  hypothetical protein  25.35 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3155  hypothetical protein  27.27 
 
 
678 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736727  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3837  protein of unknown function DUF227  22.67 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2585  protein of unknown function DUF227  24.68 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000429556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2531  aminoglycoside phosphotransferase  24.84 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2486  aminoglycoside phosphotransferase  24.84 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2549  hypothetical protein  25.33 
 
 
667 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.616235 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2523  aminoglycoside phosphotransferase  24.53 
 
 
359 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238738  normal  0.0936723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2016  aminoglycoside phosphotransferase  25.9 
 
 
367 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3102  aminoglycoside phosphotransferase  26.89 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2512  aminoglycoside phosphotransferase  25.07 
 
 
667 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2557  aminoglycoside phosphotransferase  25.07 
 
 
667 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.898182  normal  0.739218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3374  aminoglycoside phosphotransferase  25.89 
 
 
661 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.116531 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1598  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3433  aminoglycoside phosphotransferase  28.96 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0252368  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0303  hypothetical protein  23.36 
 
 
360 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.571715  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2220  hypothetical protein  24.32 
 
 
362 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02343  hypothetical protein  27.11 
 
 
364 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.445961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4330  hypothetical protein  25.44 
 
 
350 aa  52.8  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2241  hypothetical protein  28.14 
 
 
349 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.235594  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0876  protein of unknown function DUF227  28.44 
 
 
332 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>