51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1700 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1700  homospermidine synthase  100 
 
 
486 aa  1006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.914151  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2012  Homospermidine synthase  63.77 
 
 
474 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.50019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1354  homospermidine synthase  64.1 
 
 
475 aa  625  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.249376 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3337  homospermidine synthase  58.15 
 
 
471 aa  572  1e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2562  hypothetical protein  51.48 
 
 
472 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2416  hypothetical protein  51.27 
 
 
472 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1078  homospermidine synthase  55.22 
 
 
476 aa  527  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.417526 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0921  homospermidine synthase  53.47 
 
 
478 aa  511  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.126033  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1154  Homospermidine synthase  52.67 
 
 
476 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00185878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0933  Homospermidine synthase  53.52 
 
 
476 aa  505  1e-142  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3423  homospermidine synthase  51.79 
 
 
477 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4552  homospermidine synthase  53.19 
 
 
477 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900238  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2138  homospermidine synthase  53.94 
 
 
476 aa  497  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0850  homospermidine synthase  52.74 
 
 
475 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.369039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1345  homospermidine synthase  52.13 
 
 
474 aa  491  1e-138  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2003  Homospermidine synthase  52.45 
 
 
482 aa  494  1e-138  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205758  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1646  homospermidine synthase  52.98 
 
 
476 aa  494  1e-138  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4834  homospermidine synthase  52.74 
 
 
478 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109645  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2317  Homospermidine synthase  52.03 
 
 
482 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.102013  normal  0.442581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2042  homospermidine synthase  51.81 
 
 
482 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.418846  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5045  homospermidine synthase  51.81 
 
 
481 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.501527  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0451  homospermidine synthase  50.96 
 
 
476 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.045579 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5462  Homospermidine synthase  51.39 
 
 
478 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.52008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3707  homospermidine synthase  48.74 
 
 
480 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.134775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1868  homospermidine synthase  50 
 
 
470 aa  470  1e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3300  Homospermidine synthase  49.79 
 
 
483 aa  469  1e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2727  homospermidine synthase  49.36 
 
 
481 aa  465  1e-130  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2688  homospermidine synthase  49.69 
 
 
483 aa  466  1e-130  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3602  Homospermidine synthase  48.95 
 
 
483 aa  459  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35790  putative homospermidine synthase  48.69 
 
 
469 aa  454  1e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.30191e-10  decreased coverage  6.17783e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3061  homospermidine synthase  48.69 
 
 
469 aa  454  1e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0078  homospermidine synthase  46.82 
 
 
481 aa  440  1e-122  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0956  homospermidine synthase  47.54 
 
 
473 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4263  homospermidine synthase  45.97 
 
 
481 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.393392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0073  homospermidine synthase  46.19 
 
 
476 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.124838  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2947  homospermidine synthase  46.67 
 
 
472 aa  416  1e-115  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0190455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0878  Homospermidine synthase  38.59 
 
 
485 aa  348  9e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0694  homospermidine synthase  38.08 
 
 
486 aa  338  1e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1047  homospermidine synthase  37.89 
 
 
480 aa  330  3e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.129007 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2685  homospermidine synthase  38.16 
 
 
482 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0137056  normal  0.192597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2622  homospermidine synthase  38.16 
 
 
481 aa  315  1e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  30.12 
 
 
409 aa  53.1  1e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  27.12 
 
 
403 aa  48.1  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  4.18334e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  27.22 
 
 
401 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  23.98 
 
 
412 aa  47  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  26.04 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  24.56 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  26.35 
 
 
407 aa  45.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  23.93 
 
 
397 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  24.56 
 
 
412 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  25.73 
 
 
403 aa  43.5  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>