33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1601 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1601  chain A, red copper protein nitrosocyanin  100 
 
 		 137 aa  278  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000567409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1090  chain A, red copper protein nitrosocyanin  74.82 
 
 		 140 aa  216  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.61148  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1556  Nitrous-oxide reductase  43.55 
 
 		 620 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.298548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1461  Nitrous-oxide reductase  43.55 
 
 		 620 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  41.94 
 
 		 647 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2402  nitrous-oxide reductase  43.55 
 
 		 620 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00162507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1060  nitrous-oxide reductase  39.71 
 
 		 645 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.620388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1139  nitrous-oxide reductase  39.71 
 
 		 646 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.494075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3199  nitrous-oxide reductase  37.31 
 
 		 650 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.324425  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  32.97 
 
 		 864 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  33.8 
 
 		 663 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  32.97 
 
 		 862 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1483  nitrous-oxide reductase  34.85 
 
 		 644 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.150565 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0664  nitrous-oxide reductase  37.88 
 
 		 652 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2115  nitrous-oxide reductase  35.82 
 
 		 655 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62565  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.8 
 
 		 863 aa  43.9  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2325  nitrous-oxide reductase  35.82 
 
 		 690 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0995  nitrous-oxide reductase  35.82 
 
 		 660 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2060  nitrous-oxide reductase  35.82 
 
 		 693 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.840269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2255  nitrous-oxide reductase  35.82 
 
 		 691 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2861  nitrous-oxide reductase  32.86 
 
 		 645 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.7379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3142  nitrous-oxide reductase  34.29 
 
 		 648 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.39 
 
 		 865 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0428  nitrous-oxide reductase  31.43 
 
 		 649 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.859318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1793  multicopper oxidase, type 3  37.5 
 
 		 307 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4059  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 649 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00566192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4171  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 649 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1368  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 646 aa  41.2  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0655  hypothetical protein  35.62 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4917  nitrous-oxide reductase  33.33 
 
 		 646 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0125108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  29.76 
 
 		 645 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1705  hypothetical protein  24.39 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0036195  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  33.87 
 
 		 864 aa  40.4  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>