More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1592 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1592  NLP/P60  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.098676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4200  NLP/P60 protein  55.38 
 
 
156 aa  155  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2473  putative outer membrane lipoprotein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.303091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02064  hypothetical protein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2313  putative outer membrane lipoprotein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.871525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1472  putative outer membrane lipoprotein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000135569  normal  0.0170642 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2324  putative outer membrane lipoprotein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3313  putative outer membrane lipoprotein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0116683  normal  0.115135 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0783  putative outer membrane lipoprotein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1482  NLP/P60 protein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02105  predicted peptidase, outer membrane lipoprotein  52.38 
 
 
188 aa  144  7e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2451  putative outer membrane lipoprotein  40.83 
 
 
190 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.18421e-09 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2565  putative outer membrane lipoprotein  40.83 
 
 
190 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.159761  hitchhiker  0.000144355 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2454  putative outer membrane lipoprotein  40.83 
 
 
190 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00195047  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2771  putative outer membrane lipoprotein  53.78 
 
 
189 aa  143  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.805322  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2335  putative outer membrane lipoprotein  53.78 
 
 
191 aa  141  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1628  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
155 aa  140  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4872  NLP/P60 protein  46.88 
 
 
183 aa  139  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2784  putative outer membrane lipoprotein  52.1 
 
 
194 aa  139  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2772  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
157 aa  139  2e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2707  putative outer membrane lipoprotein  52.1 
 
 
194 aa  139  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0063  NLP/P60 protein  42.33 
 
 
164 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0062  NLP/P60 protein  42.33 
 
 
154 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1501  putative outer membrane lipoprotein  52.1 
 
 
172 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2466  NLP/P60 protein  42.33 
 
 
162 aa  138  4e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.291366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0052  NLP/P60 protein  41.1 
 
 
154 aa  137  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00304715  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2363  putative outer membrane lipoprotein  51.26 
 
 
147 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  2.43067e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1657  NLP/P60 protein  45.51 
 
 
154 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.983654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2408  putative outer membrane lipoprotein  51.26 
 
 
147 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.10623e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2161  NLP/P60 protein  43.86 
 
 
154 aa  137  8e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.854022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0061  NLP/P60 family lipoprotein  40.83 
 
 
154 aa  137  8e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4465  NLP/P60 protein  48.41 
 
 
150 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.231412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  39.66 
 
 
191 aa  134  6e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0061  NLP/P60 protein  40.49 
 
 
159 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  4.1841e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0059  NLP/P60 protein  40.49 
 
 
159 aa  134  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.560848  hitchhiker  0.000388338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0063  NLP/P60 protein  40.49 
 
 
159 aa  134  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56196e-07 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3244  putative outer membrane lipoprotein  48.74 
 
 
191 aa  131  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4296  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
164 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.346407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0058  NLP/P60 protein  49.57 
 
 
164 aa  131  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1646  putative outer membrane lipoprotein  47.9 
 
 
194 aa  130  1e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1734  NLP/P60 protein  40.12 
 
 
154 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3992  NLP/P60 protein  54.05 
 
 
196 aa  128  4e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  8.56339e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1118  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
189 aa  127  5e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.579853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1732  NlpC/P60 family lipoprotein  40.35 
 
 
154 aa  127  9e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1838  NLP/P60 protein  40.35 
 
 
154 aa  127  9e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1917  putative outer membrane lipoprotein  47.06 
 
 
193 aa  127  1e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3689  NLP/P60 family lipoprotein  50 
 
 
179 aa  125  2e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1830  NlpC (ORF-17)  40.12 
 
 
154 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1454  putative lipoprotein nlpC  40.12 
 
 
154 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.297729  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1471  hypothetical protein  40.12 
 
 
154 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1438  NlpC (ORF-17)  40.12 
 
 
154 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0813186 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2002  putative lipoprotein nlpC  40.12 
 
 
154 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.303201 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0069  NLP/P60 family lipoprotein  40.13 
 
 
148 aa  124  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2605  NlpC/P60 family lipoprotein  42.95 
 
 
143 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0958  NLP/P60 protein  46.55 
 
 
167 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.414472  normal  0.258055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1927  NlpC/P60 family lipoprotein  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00858399  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1934  NLP/P60 protein  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0636747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1923  NLP/P60 protein  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.468553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1482  NlpC/P60 family lipoprotein  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2426  lipoprotein, NlpC/P60 family  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01666  hypothetical protein  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01677  predicted lipoprotein  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1788  NlpC/P60 family lipoprotein  43.57 
 
 
154 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1387  putative lipoprotein  38.36 
 
 
162 aa  121  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0376898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1912  lipoprotein, NlpC/P60 family  42.86 
 
 
154 aa  120  1e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1142  lipoprotein NlpC  37.42 
 
 
166 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0142689  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02243  hypothetical protein  35.5 
 
 
162 aa  117  8e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0391  NlpC/P60 family protein  44.54 
 
 
195 aa  113  1e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1293  NLP/P60  40.68 
 
 
205 aa  112  2e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0496746  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3902  NLP/P60 protein  42.54 
 
 
171 aa  110  8e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1825  lipoprotein NlpC  48.65 
 
 
152 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0427  NLP/P60 protein  39.37 
 
 
240 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1644  lipoprotein NlpC  47.75 
 
 
153 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0428  NLP/P60 protein  41.59 
 
 
173 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  49.17 
 
 
150 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  40.88 
 
 
346 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1014  NLP/P60 protein  38.02 
 
 
211 aa  97.4  8e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2819  NLP/P60 protein  43.97 
 
 
159 aa  97.4  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  41.61 
 
 
342 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.3444e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0230  NLP/P60 protein  40.48 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.382299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2178  NLP/P60 protein  42.45 
 
 
193 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1274  NLP/P60 protein  36.15 
 
 
207 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.951335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  41.61 
 
 
342 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  38.97 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2446  NLP/P60 protein  42.24 
 
 
208 aa  95.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  48.18 
 
 
205 aa  95.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  45.37 
 
 
224 aa  94.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0170  NLP/P60 protein  39.06 
 
 
184 aa  94  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2100  NLP/P60 protein  39.02 
 
 
302 aa  94  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.660776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
246 aa  94  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
223 aa  94  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
218 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
218 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  44.44 
 
 
218 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  44.44 
 
 
234 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  44.44 
 
 
218 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.76333e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
341 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.54936e-13  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.37 
 
 
223 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
223 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  45.37 
 
 
223 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>