175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1566 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 
1119 aa  2195  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  49.11 
 
 
650 aa  532  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  41.58 
 
 
2003 aa  508  1e-142  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  36.97 
 
 
1881 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.77 
 
 
1227 aa  460  1e-128  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.96 
 
 
1029 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.67 
 
 
1508 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  37.16 
 
 
1550 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  39.12 
 
 
1782 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  36.98 
 
 
1519 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  36.86 
 
 
2396 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  37.5 
 
 
2366 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  1.66918e-09 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  38.41 
 
 
2365 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  38.41 
 
 
2346 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  39.1 
 
 
995 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  38.75 
 
 
986 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  37.53 
 
 
2371 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.56 
 
 
919 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.81 
 
 
1285 aa  365  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  36.83 
 
 
3506 aa  359  2e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.4 
 
 
972 aa  349  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.2 
 
 
1081 aa  342  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.44 
 
 
1848 aa  341  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  37.99 
 
 
1004 aa  324  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  37.81 
 
 
1033 aa  322  3e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  31.72 
 
 
4238 aa  316  1e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  31.69 
 
 
3822 aa  315  3e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.59 
 
 
991 aa  311  3e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.39 
 
 
2711 aa  311  4e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  32.97 
 
 
4238 aa  306  1e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  38.52 
 
 
1028 aa  306  1e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  3.68637e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.82 
 
 
1011 aa  303  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  37.32 
 
 
1001 aa  302  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
3954 aa  299  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  36.17 
 
 
995 aa  298  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  36.14 
 
 
1001 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  35.56 
 
 
1055 aa  290  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  35.21 
 
 
1038 aa  286  1e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.96 
 
 
1532 aa  277  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  34.16 
 
 
983 aa  277  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  32.48 
 
 
1056 aa  271  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  35.4 
 
 
1333 aa  270  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  35.01 
 
 
1164 aa  268  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  32.93 
 
 
1131 aa  268  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  32.93 
 
 
1129 aa  268  6e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  32.78 
 
 
1131 aa  266  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  32.78 
 
 
1131 aa  266  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  32.78 
 
 
1131 aa  266  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  32.78 
 
 
1129 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  32.93 
 
 
1131 aa  260  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  32.29 
 
 
1130 aa  259  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  33.81 
 
 
990 aa  258  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  37.02 
 
 
1053 aa  254  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  36.1 
 
 
1062 aa  240  9e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  44.29 
 
 
2578 aa  237  1e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  32.04 
 
 
677 aa  231  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.55 
 
 
1125 aa  226  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  32.61 
 
 
1006 aa  226  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.69 
 
 
985 aa  207  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  30.78 
 
 
980 aa  205  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.24 
 
 
1322 aa  203  2e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  6.38249e-09 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  30.44 
 
 
994 aa  197  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.22 
 
 
1152 aa  194  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  45.87 
 
 
2906 aa  194  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  35.2 
 
 
1530 aa  191  6e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  31.73 
 
 
1016 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  34.33 
 
 
1011 aa  187  9e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.74 
 
 
3629 aa  186  2e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 
1769 aa  176  3e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.91 
 
 
3322 aa  167  7e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.4 
 
 
1489 aa  162  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  27.78 
 
 
2407 aa  161  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.78 
 
 
1113 aa  157  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  30.54 
 
 
816 aa  151  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  32.54 
 
 
1971 aa  151  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  33.69 
 
 
1111 aa  144  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  27.85 
 
 
1180 aa  144  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  38.18 
 
 
2926 aa  142  4e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  33.39 
 
 
1130 aa  136  2e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  36.81 
 
 
1458 aa  135  4e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  33.14 
 
 
1459 aa  134  7e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.48 
 
 
3391 aa  129  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  28.68 
 
 
488 aa  128  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.1 
 
 
861 aa  126  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  4.58443e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  28.89 
 
 
994 aa  125  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  31.1 
 
 
2057 aa  121  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 
407 aa  120  2e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  37.2 
 
 
1741 aa  120  2e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  37.54 
 
 
2363 aa  115  4e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  46.5 
 
 
3420 aa  115  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  46.5 
 
 
3415 aa  115  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  32.01 
 
 
1882 aa  114  1e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  39.68 
 
 
1571 aa  109  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  42.36 
 
 
1593 aa  107  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  27.5 
 
 
1019 aa  107  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  38.65 
 
 
1861 aa  107  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.32 
 
 
1066 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.07412e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 
1369 aa  100  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  25.82 
 
 
1325 aa  99  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.58 
 
 
926 aa  97.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>