More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1426 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 720 aa  1458    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  44.2 
 
 		 726 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  46.09 
 
 		 709 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  45.26 
 
 		 742 aa  569  1e-161  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  44.66 
 
 		 694 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  43.23 
 
 		 706 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  42.13 
 
 		 721 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  43.37 
 
 		 706 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  43.37 
 
 		 706 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  42.13 
 
 		 706 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 715 aa  544  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  44.09 
 
 		 731 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  42.67 
 
 		 700 aa  532  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  42.67 
 
 		 700 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  40.88 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  43.13 
 
 		 700 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  42.39 
 
 		 700 aa  528  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  43.13 
 
 		 700 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  42.98 
 
 		 700 aa  526  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 700 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  42.98 
 
 		 700 aa  526  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 700 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  42.19 
 
 		 728 aa  525  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  43.11 
 
 		 705 aa  522  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  42.03 
 
 		 706 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  42.49 
 
 		 736 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  41.78 
 
 		 681 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  41.67 
 
 		 710 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  40.94 
 
 		 712 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  41.26 
 
 		 697 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  39.2 
 
 		 701 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  39.43 
 
 		 723 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  39.3 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  40.81 
 
 		 723 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  33.82 
 
 		 688 aa  353  7e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 675 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 678 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 705 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  30.26 
 
 		 691 aa  266  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 680 aa  261  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  25.42 
 
 		 701 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 770 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 780 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  25.71 
 
 		 797 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 734 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 736 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 681 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 703 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.09 
 
 		 727 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 726 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 682 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 757 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 742 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 778 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 688 aa  114  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 680 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 698 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 774 aa  111  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 702 aa  111  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 700 aa  111  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  24.01 
 
 		 690 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 788 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 777 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 777 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 737 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 777 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 706 aa  105  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  24.36 
 
 		 712 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 696 aa  104  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 716 aa  104  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 681 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 715 aa  100  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 713 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 678 aa  99.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2990  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 656 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 717 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 657 aa  97.4  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 698 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 733 aa  94.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.33 
 
 		 695 aa  93.6  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 791 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 779 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1968  TonB-dependent heme receptor  24.49 
 
 		 690 aa  92.4  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  25.26 
 
 		 646 aa  91.3  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  23.4 
 
 		 792 aa  90.9  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2292  OM receptor TonB  23.54 
 
 		 935 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  25.52 
 
 		 692 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2666  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 638 aa  89.7  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 769 aa  89  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 757 aa  88.6  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  23 
 
 		 762 aa  87.8  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 665 aa  87.4  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 730 aa  87  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 644 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 791 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1786  TonB-dependent heme receptor  24.14 
 
 		 718 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3176  TonB-dependent siderophore receptor  23.37 
 
 		 653 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  22.78 
 
 		 706 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3472  TonB-dependent siderophore receptor  23.32 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0503687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>