More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1421 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1421  ABC transporter related  100 
 
 
599 aa  1210    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.316011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  64.24 
 
 
593 aa  731    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  60.71 
 
 
583 aa  687    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  59.01 
 
 
589 aa  701    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  66.5 
 
 
593 aa  789    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  56.07 
 
 
588 aa  622  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  50.8 
 
 
587 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2391  ABC transporter related  53.24 
 
 
599 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  54.66 
 
 
578 aa  532  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  49.74 
 
 
582 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  49.56 
 
 
583 aa  527  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  49.12 
 
 
580 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
580 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  48.24 
 
 
576 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  48.57 
 
 
578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  48.39 
 
 
1106 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
585 aa  513  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  48.63 
 
 
581 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  47.29 
 
 
578 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 
578 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  47.28 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  48.09 
 
 
578 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  47.29 
 
 
578 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
578 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
578 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
578 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  46.46 
 
 
575 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  47.12 
 
 
578 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  47.16 
 
 
579 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  47.29 
 
 
578 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  47.92 
 
 
578 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  47.27 
 
 
580 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  47.28 
 
 
578 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  48.63 
 
 
585 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  49.38 
 
 
576 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  46.8 
 
 
582 aa  501  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  48.25 
 
 
580 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  49.03 
 
 
592 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  49.03 
 
 
592 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1779  ABC transporter, ATPase subunit  49.91 
 
 
579 aa  488  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  46.46 
 
 
590 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  46.84 
 
 
594 aa  488  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  47 
 
 
590 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  44.85 
 
 
580 aa  476  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  44.68 
 
 
580 aa  475  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  42.06 
 
 
651 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1492  ABC transporter related  44.73 
 
 
617 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  39.08 
 
 
551 aa  403  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  38.26 
 
 
541 aa  384  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.46 
 
 
510 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  39.83 
 
 
667 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  40.21 
 
 
904 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  40.77 
 
 
901 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  38.37 
 
 
918 aa  364  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.85 
 
 
913 aa  363  5.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  38.1 
 
 
906 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.86 
 
 
914 aa  359  9e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  40.46 
 
 
916 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  38.86 
 
 
930 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  41.32 
 
 
901 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  41.32 
 
 
901 aa  353  7e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  39.5 
 
 
924 aa  349  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  39.46 
 
 
916 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.93 
 
 
916 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  37.21 
 
 
922 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  37.57 
 
 
936 aa  337  5e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  37.57 
 
 
936 aa  336  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  38.43 
 
 
917 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  37.43 
 
 
922 aa  330  4e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  37.79 
 
 
911 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2838  Fis family transcriptional regulator  60.08 
 
 
1171 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.360962  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  57.66 
 
 
312 aa  257  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  32.74 
 
 
921 aa  253  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  47.08 
 
 
512 aa  250  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  56.16 
 
 
314 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  52.68 
 
 
314 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  50.22 
 
 
319 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  48.33 
 
 
319 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 
320 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  51.87 
 
 
308 aa  241  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  47.45 
 
 
257 aa  240  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  48.88 
 
 
324 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  51.57 
 
 
322 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 
322 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  45.56 
 
 
247 aa  236  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
319 aa  236  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  49.56 
 
 
325 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  51.39 
 
 
322 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  45.36 
 
 
312 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  52.58 
 
 
322 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  44.72 
 
 
270 aa  233  8.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  52.09 
 
 
333 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  43.15 
 
 
248 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  50.45 
 
 
309 aa  231  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  48.1 
 
 
314 aa  230  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  46.15 
 
 
315 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  47.79 
 
 
316 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.57 
 
 
907 aa  227  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>