More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1246 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  100 
 
 		 1020 aa  2100    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1734  ATPase-like protein  36.04 
 
 		 977 aa  308  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.29 
 
 		 973 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 1015 aa  132  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.6 
 
 		 954 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.39 
 
 		 967 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  26.56 
 
 		 983 aa  125  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.19 
 
 		 1005 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 		 1160 aa  124  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.7 
 
 		 1134 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.17 
 
 		 916 aa  118  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.39 
 
 		 992 aa  117  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.21 
 
 		 1081 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.65 
 
 		 1422 aa  115  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.94 
 
 		 1175 aa  114  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 		 1013 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.79 
 
 		 1080 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.59 
 
 		 1429 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.49 
 
 		 1105 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  25.98 
 
 		 1126 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.63 
 
 		 1291 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  26.59 
 
 		 1006 aa  107  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  25.61 
 
 		 982 aa  105  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.2 
 
 		 1141 aa  104  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.5 
 
 		 1093 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.75 
 
 		 1149 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  25.22 
 
 		 970 aa  101  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.31 
 
 		 1089 aa  101  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  24.6 
 
 		 1148 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 1311 aa  99.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  26.34 
 
 		 900 aa  98.6  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.37 
 
 		 1295 aa  98.6  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 		 1138 aa  97.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  23.79 
 
 		 1037 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  23.01 
 
 		 1122 aa  97.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  23.43 
 
 		 1403 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  25.2 
 
 		 1029 aa  95.5  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  23.27 
 
 		 993 aa  95.5  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 		 1188 aa  95.5  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 967 aa  94.7  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  26.41 
 
 		 1022 aa  94.4  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.1 
 
 		 1264 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 		 1151 aa  94  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 981 aa  93.2  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.07 
 
 		 1139 aa  92.4  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.56 
 
 		 919 aa  92.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  25 
 
 		 1054 aa  91.3  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  22.22 
 
 		 1147 aa  91.3  9e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  23.64 
 
 		 1048 aa  91.3  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  23.52 
 
 		 1298 aa  90.9  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  25 
 
 		 1029 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  28.82 
 
 		 1340 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.81 
 
 		 1360 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.51 
 
 		 1151 aa  90.1  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  24.52 
 
 		 1402 aa  89.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.09 
 
 		 1117 aa  89  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.63 
 
 		 1055 aa  88.6  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.21 
 
 		 1227 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  24.67 
 
 		 1118 aa  85.9  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  27.63 
 
 		 1084 aa  85.1  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1544  transcriptional regulator, CadC  35.71 
 
 		 1089 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3508  putative transcriptional regulator  35.78 
 
 		 712 aa  84  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1508  transcriptional regulator, CadC  32.58 
 
 		 1089 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.76281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  25.11 
 
 		 999 aa  84.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  26.43 
 
 		 959 aa  84  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.75 
 
 		 1271 aa  84.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2838  transcriptional regulator, CadC  32.58 
 
 		 1075 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.199766  normal  0.195433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  29.08 
 
 		 1383 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.36 
 
 		 1808 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  22.9 
 
 		 2051 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  21.89 
 
 		 1914 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  20.32 
 
 		 1932 aa  82.4  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.06 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.92 
 
 		 852 aa  81.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  26.13 
 
 		 1121 aa  81.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  23.81 
 
 		 1133 aa  81.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  24.49 
 
 		 966 aa  80.9  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  26.05 
 
 		 1013 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  25.84 
 
 		 1193 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  24.4 
 
 		 1051 aa  80.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.75 
 
 		 1441 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  20.32 
 
 		 1805 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1517  transcriptional regulator, CadC  34.62 
 
 		 1067 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.02 
 
 		 1403 aa  79.7  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  23.81 
 
 		 1063 aa  79.7  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4571  transcriptional regulator domain-containing protein  38.74 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1415  transcriptional regulator, CadC  34.42 
 
 		 1092 aa  79  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.931625  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 		 864 aa  78.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  22.45 
 
 		 1377 aa  78.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  24.73 
 
 		 998 aa  78.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  23.39 
 
 		 1668 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  22.22 
 
 		 1826 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  25.42 
 
 		 1118 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  23.62 
 
 		 1123 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  27.61 
 
 		 957 aa  77  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  23.76 
 
 		 1055 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  25.48 
 
 		 1123 aa  76.3  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 1422 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  21.76 
 
 		 1468 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  26.15 
 
 		 1071 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>