More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1122 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  100 
 
 
141 aa  287  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  48.12 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  49.26 
 
 
138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 
140 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  43.28 
 
 
151 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  48.09 
 
 
137 aa  120  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  45.11 
 
 
135 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  42.65 
 
 
138 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  43.51 
 
 
161 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 
140 aa  114  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  41.22 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  40.46 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  41.09 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  41.09 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  41.09 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  41.09 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  41.09 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  41.09 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  42.54 
 
 
135 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  41.09 
 
 
135 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  40.31 
 
 
135 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  38.46 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  41.04 
 
 
138 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
142 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  41.73 
 
 
128 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  38.46 
 
 
140 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  38.35 
 
 
135 aa  99.4  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  36.76 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  36.76 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  36.15 
 
 
140 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  36.15 
 
 
140 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  36.03 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  40.29 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  37.04 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  37.04 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  36.09 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  37.31 
 
 
135 aa  94  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  39.71 
 
 
140 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  39.55 
 
 
136 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  37.59 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  51.72 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  41.28 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  33.81 
 
 
148 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 
144 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  41.28 
 
 
139 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  35.56 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  36.72 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  34.31 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  36.03 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  35.29 
 
 
145 aa  84.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  37.8 
 
 
170 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  33.08 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  33.08 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  42.16 
 
 
145 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  34.59 
 
 
132 aa  82  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  34.59 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  38.32 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  38.32 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
269 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  35.16 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4469  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  36.03 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  34.56 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  36.94 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  33.82 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  34.09 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0048  Rhodanese domain protein  40 
 
 
144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0338944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4331  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  33.33 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
149 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  41.11 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 
149 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  33.09 
 
 
144 aa  77  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  36.7 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  34.78 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  35.78 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  38.1 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  36.64 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  44.71 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2737  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 
125 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.909386  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1955  rhodanese-like protein  34.06 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000116942  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  34.86 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  45.88 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  37.14 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  36.19 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  32.77 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  32.77 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  32.77 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  29.55 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0856379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>