289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1040 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  100 
 
 		 524 aa  1091    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5308  Lysine decarboxylase  32.96 
 
 		 958 aa  317  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  36.69 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  33.86 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12551  amino acid decarboxylase  33.55 
 
 		 947 aa  287  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0500695 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.54 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.06 
 
 		 509 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  35.29 
 
 		 490 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  35.29 
 
 		 536 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  34.87 
 
 		 490 aa  281  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1585  arginine decarboxylase  32.79 
 
 		 947 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00962069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  34.56 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  34.56 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  34.56 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  34.36 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  34.66 
 
 		 490 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  34.15 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.02 
 
 		 490 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.47 
 
 		 490 aa  276  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.26 
 
 		 490 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.26 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.82 
 
 		 508 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.63 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  35.15 
 
 		 488 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.16 
 
 		 491 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.16 
 
 		 491 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.74 
 
 		 488 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5196  lysine decarboxylase  31.83 
 
 		 756 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.86 
 
 		 491 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  32.67 
 
 		 751 aa  256  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  32.28 
 
 		 751 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  33.06 
 
 		 486 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.52 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1009  lysine decarboxylase  31.77 
 
 		 626 aa  250  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.187258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.43 
 
 		 482 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.54 
 
 		 486 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2188  ornithine decarboxylase  33.51 
 
 		 751 aa  249  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.19 
 
 		 474 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  31.89 
 
 		 749 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.89 
 
 		 485 aa  248  3e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  31.35 
 
 		 487 aa  246  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2068  lysine decarboxylase  32.03 
 
 		 747 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.014755  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  31.47 
 
 		 485 aa  244  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2754  ornithine decarboxylase  31.18 
 
 		 754 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.135744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2578  Lysine decarboxylase  30.98 
 
 		 759 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.181221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2365  biodegradative arginine decarboxylase protein  30.71 
 
 		 759 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0493181 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29580  Ornithine/lysine/arginine decarboxylase  31.78 
 
 		 746 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2174  Lysine decarboxylase  30.82 
 
 		 759 aa  242  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0762291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0651  lysine decarboxylase  30.49 
 
 		 755 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  31.36 
 
 		 767 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0578  ornithine decarboxylase  29.35 
 
 		 742 aa  240  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.986824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0689  ornithine decarboxylase  31.49 
 
 		 756 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.9866  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  30.83 
 
 		 473 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0144  lysine decarboxylase  31.33 
 
 		 769 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.263338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  29.46 
 
 		 542 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1204  Lysine decarboxylase  30.05 
 
 		 755 aa  239  8e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000345453  normal  0.552697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3465  lysine decarboxylase  32.06 
 
 		 749 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0915  lysine decarboxylase  30.11 
 
 		 746 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1059  ornithine decarboxylase  30.11 
 
 		 746 aa  239  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0862  lysine decarboxylase  30.55 
 
 		 759 aa  238  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.774343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2106  ornithine decarboxylase  30.56 
 
 		 747 aa  238  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.543581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2967  ornithine decarboxylase  30.07 
 
 		 757 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.482503  normal  0.818361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3514  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 766 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0354739 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2345  lysine decarboxylase  30.55 
 
 		 759 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.964996  normal  0.113282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2479  lysine decarboxylase  30.55 
 
 		 759 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.506785  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4356  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 794 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4010  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 794 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.622198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1886  lysine decarboxylase  29.71 
 
 		 751 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1821  lysine decarboxylase  30.38 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2252  Lysine decarboxylase  29.98 
 
 		 789 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2432  lysine decarboxylase  30.38 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0158753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1590  Lysine decarboxylase  30.92 
 
 		 747 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.334363  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2762  ornithine decarboxylase  29.98 
 
 		 789 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2437  lysine decarboxylase  30.38 
 
 		 759 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0716187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5763  lysine decarboxylase  30.38 
 
 		 759 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.318981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3712  lysine decarboxylase  32.69 
 
 		 757 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1088  Lysine decarboxylase  29.9 
 
 		 753 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2393  Lysine decarboxylase  30.24 
 
 		 762 aa  233  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.736843  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  31.24 
 
 		 489 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2126  lysine decarboxylase  29.18 
 
 		 762 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3257  lysine decarboxylase  30.03 
 
 		 793 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2074  response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 766 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0189662  normal  0.738564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2415  ornithine decarboxylase  29.54 
 
 		 764 aa  233  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.94 
 
 		 485 aa  233  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1611  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.34 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175445  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0715  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.34 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.395264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1216  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.34 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0779  arginine decarboxylase  30.2 
 
 		 779 aa  232  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0975108  normal  0.0520497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0861  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.02 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.206797  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2298  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.34 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3498  lysine decarboxylase  29.52 
 
 		 772 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0638037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1925  ornithine decarboxylase  30.3 
 
 		 753 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2988  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.34 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.541355  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1058  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.34 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1064  Orn/Lys/Arg decarboxylase  30.34 
 
 		 759 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2964  lysine decarboxylase  29.55 
 
 		 871 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3477  ornithine decarboxylase  29.77 
 
 		 761 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2186  lysine decarboxylase  29.44 
 
 		 760 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0975891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2491  lysine decarboxylase  31.33 
 
 		 712 aa  229  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0272  lysine decarboxylase, constitutive  30.9 
 
 		 713 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.549018  normal  0.511484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>