227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1032 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  100 
 
 
399 aa  819  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3705  putative RNA methylase  55.05 
 
 
387 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  53.14 
 
 
385 aa  426  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0282  putative RNA methylase:THUMP  51.72 
 
 
380 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.377639  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2424  N6-adenine-specific DNA methylase  49.74 
 
 
398 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0623  putative RNA methylase  44.86 
 
 
432 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244531  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2374  THUMP domain-containing protein  47.07 
 
 
430 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1265  THUMP domain-containing protein  46.6 
 
 
430 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3387  N6-adenine-specific DNA methylase  47.07 
 
 
430 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2557  THUMP domain-containing protein  47.07 
 
 
430 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3378  THUMP domain-containing protein  47.07 
 
 
430 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.270297  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0288  THUMP domain-containing protein  47.07 
 
 
430 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1150  THUMP domain-containing protein  47.07 
 
 
430 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3344  THUMP domain-containing protein  47.07 
 
 
430 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4003  hypothetical protein  46.23 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.656935  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0598  putative RNA methylase  44.16 
 
 
432 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0696  putative RNA methylase  44.96 
 
 
433 aa  358  1e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273634  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2677  putative RNA methylase  43.95 
 
 
432 aa  352  7e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2537  putative RNA methylase  45.54 
 
 
425 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0675  putative RNA methylase  44.06 
 
 
434 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.936037  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0224  putative RNA methylase  43.82 
 
 
434 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0708  putative RNA methylase  43.82 
 
 
434 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3795  putative RNA methylase  43.59 
 
 
433 aa  347  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405369  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2828  putative RNA methylase:THUMP  45.59 
 
 
417 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.712566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2967  putative RNA methylase  45.56 
 
 
419 aa  343  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  42.4 
 
 
376 aa  302  6e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0339  putative RNA methylase  39.86 
 
 
437 aa  302  7e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.179905  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0350  putative RNA methylase  39.86 
 
 
440 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  42.47 
 
 
391 aa  299  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0259  putative RNA methylase  38.27 
 
 
480 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0237  putative RNA methylase  37.79 
 
 
485 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.601089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0422  putative RNA methylase  39.52 
 
 
441 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.472219  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0579  putative RNA methylase  41.36 
 
 
430 aa  297  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  41.87 
 
 
376 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3994  putative RNA methylase  41.08 
 
 
375 aa  296  5e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.18402e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0398  putative RNA methylase:THUMP  41.67 
 
 
389 aa  295  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0174402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2822  putative RNA methylase  41.55 
 
 
393 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0683  putative RNA methylase  38.31 
 
 
426 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0473  putative RNA methylase  39.42 
 
 
413 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  40.76 
 
 
393 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2739  hypothetical protein  39.47 
 
 
471 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.895962  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0779  putative RNA methylase  39.25 
 
 
428 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1292  putative RNA methylase  38.65 
 
 
375 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.963614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1261  putative RNA methylase  38.65 
 
 
375 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4180  putative RNA methylase  37.56 
 
 
440 aa  277  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2568  putative RNA methylase  46.77 
 
 
472 aa  267  3e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.509771 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.97 
 
 
711 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2978  putative RNA methylase  47.08 
 
 
472 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.22 
 
 
713 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.64 
 
 
713 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.64 
 
 
713 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2661  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.72 
 
 
712 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2473  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.72 
 
 
711 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00287682 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0249  putative RNA methylase  38.07 
 
 
374 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0789594  normal  0.0276638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00591  RNA methylase family protein  39.29 
 
 
374 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.86 
 
 
711 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.03 
 
 
708 aa  260  4e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  37.13 
 
 
380 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1263  N6-adenine-specific DNA methylase-like  39.68 
 
 
374 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0245346  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2610  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.86 
 
 
709 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.68014e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2685  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.86 
 
 
709 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.379022  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3711  putative RNA methylase  42.09 
 
 
471 aa  256  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.770893  normal  0.0760034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0889  putative RNA methylase  39.78 
 
 
375 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1774  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.6 
 
 
709 aa  256  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.828749  hitchhiker  0.000200873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4484  putative RNA methylase  41.59 
 
 
468 aa  256  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2570  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.6 
 
 
709 aa  256  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0113028  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.6 
 
 
709 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.9 
 
 
711 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2143  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.47 
 
 
711 aa  252  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  37.34 
 
 
711 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2072  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.74 
 
 
713 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0712  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  39.95 
 
 
738 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1952  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  38.96 
 
 
712 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.64464  normal  0.031867 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2283  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.53 
 
 
749 aa  247  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.402285  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03361  RNA methylase family protein  35.68 
 
 
374 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2495  putative RNA methylase  37.77 
 
 
387 aa  238  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.48 
 
 
718 aa  238  2e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0499  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.43 
 
 
734 aa  235  8e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.639423  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1752  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.84 
 
 
752 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.935518  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0147  N6-adenine-specific DNA methylase-like protein  46.5 
 
 
779 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00641  RNA methylase family protein  32.63 
 
 
374 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0054  putative RNA methylase  32.1 
 
 
374 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2035  putative RNA methylase  36.39 
 
 
395 aa  230  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.06959e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08561  putative N6-adenine-specific DNA methylase  37.13 
 
 
381 aa  230  4e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00621  RNA methylase family protein  32.36 
 
 
374 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1743  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.68 
 
 
706 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.171189  hitchhiker  0.000865534 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2250  putative RNA methylase  36.59 
 
 
380 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.959304  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  37.67 
 
 
388 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.08 
 
 
706 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.08 
 
 
706 aa  226  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  35.08 
 
 
706 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00611  RNA methylase family protein  33.42 
 
 
374 aa  226  5e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1102  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
702 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.907291  normal  0.597986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1019  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
702 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.63679e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1136  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
702 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.237115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1170  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
702 aa  226  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.988002  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4012  putative RNA methylase  36.36 
 
 
387 aa  225  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.206929  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1123  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.67 
 
 
702 aa  225  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.482785  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0412  putative RNA methylase  37.37 
 
 
382 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2369  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  34.3 
 
 
702 aa  222  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0183103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>