More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1000 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1000  histidine kinase  100 
 
 		 385 aa  793    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.146298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0832  histidine kinase  70.67 
 
 		 383 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.636786  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4475  histidine kinase  38.38 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000400204 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2123  sensor histidine kinase  28.99 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3541  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 495 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1170  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364137  hitchhiker  0.00137418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2279  histidine kinase  31.08 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5936  histidine kinase  27.57 
 
 		 373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 595 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2058  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 618 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1918  sensor histidine kinase  27.63 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3149  histidine kinase  28.62 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.458506  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6438  histidine kinase  27.24 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 763 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3968  sensor histidine kinase  27.85 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.838601  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 621 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0030  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1171 aa  119  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2988  histidine kinase  26.62 
 
 		 380 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.539821  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4439  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4368  histidine kinase  25.47 
 
 		 373 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2123  histidine kinase  27.27 
 
 		 373 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.71002  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0256  histidine kinase  28.08 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.459774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  33.19 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 734 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.656612  hitchhiker  0.0000890263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2762  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1997  histidine kinase  26.56 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.337155  normal  0.0103218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.67 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 592 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3993  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 390 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.967169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 543 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  31.25 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 592 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0278  histidine kinase  27.59 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4896  sensor histidine kinase  25.91 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 461 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00764508  normal  0.232997 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5450  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 799 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0267  histidine kinase  27.59 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 		 1362 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 781 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4207  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 370 aa  107  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 456 aa  106  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  30.57 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0619  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 379 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0923552  normal  0.109315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 403 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 672 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 763 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287383  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3773  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.33 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719874  normal  0.310272 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 816 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  29.82 
 
 		 827 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  31.7 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.745377  normal  0.599724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3912  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 		 912 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237166  normal  0.236216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 763 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 490 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 679 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 763 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1495  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1522  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2321  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.988363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  29.02 
 
 		 469 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 518 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1666  histidine kinase  24.55 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0535  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 383 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.143908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3183  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 442 aa  102  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.319198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 590 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  29 
 
 		 1361 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2993  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1070 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  30.09 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 463 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0278  histidine kinase  29.33 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2237  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 381 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.5102  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2325  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.830525  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  28.51 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  31.03 
 
 		 1344 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3107  histidine kinase  29.28 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0617  sensor kinase CusS  30.63 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00400896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3076  sensor kinase CusS  30.63 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  29.65 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5387  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0971839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 460 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0588  sensor kinase CusS  30.63 
 
 		 482 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.595932  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 468 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0553  histidine kinase  27.35 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  28.07 
 
 		 470 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 486 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1287 aa  99.8  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  28.18 
 
 		 406 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00531  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CusR, senses copper ions  30.63 
 
 		 482 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  28.14 
 
 		 422 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 460 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>