79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0989 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0989  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0217  hypothetical protein  37.63 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0697  hypothetical protein  33.91 
 
 
196 aa  111  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0651  Sterol-binding domain protein  34.05 
 
 
214 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.934133 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2781  hypothetical protein  32.29 
 
 
208 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0376  sterol-binding domain-containing protein  33.51 
 
 
214 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.340906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2648  sterol-binding domain-containing protein  33.51 
 
 
208 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238877  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0569  hypothetical protein  31.77 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441194  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2730  hypothetical protein  32.97 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.722232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2757  sterol-binding domain-containing protein  32.97 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2118  hypothetical protein  32.97 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935864  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6057  hypothetical protein  32.43 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0555  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0847  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2400  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2758  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0669  hypothetical protein  31.25 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2320  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4048  hypothetical protein  31.89 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.601005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4116  hypothetical protein  30.98 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.804871  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0685  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0460  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  94  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0335  Sterol-binding domain protein  31.67 
 
 
220 aa  87  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0373  hypothetical protein  33.66 
 
 
223 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0350  Sterol-binding domain protein  31.11 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1895  hypothetical protein  29.74 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.254922  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1600  protein of unknown function DUF1243  29.95 
 
 
206 aa  79.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0433  hypothetical protein  30.21 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2344  hypothetical protein  30.97 
 
 
202 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00563  hypothetical protein  27.94 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001926  hypothetical protein  28.03 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0783  hypothetical protein  32.54 
 
 
231 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0070  hypothetical protein  30.12 
 
 
209 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0862  hypothetical protein  32.8 
 
 
201 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0289469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0060  Sterol-binding domain protein  31 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2431  hypothetical protein  25.78 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0388  hypothetical protein  27.78 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2997  hypothetical protein  26.19 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2819  hypothetical protein  26.18 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1066  hypothetical protein  30.88 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0386  hypothetical protein  29.02 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778532  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2971  hypothetical protein  25.65 
 
 
205 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0066  hypothetical protein  28.3 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2119  hypothetical protein  28.3 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.145601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5459  hypothetical protein  31.25 
 
 
212 aa  51.2  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.681544  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1206  hypothetical protein  25.6 
 
 
192 aa  51.2  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0258  hypothetical protein  57.89 
 
 
377 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5803  hypothetical protein  30.73 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4127  hypothetical protein  30.08 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1320  hypothetical protein  33.9 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0185513  hitchhiker  0.00829075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1293  hypothetical protein  27.27 
 
 
184 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0295  hypothetical protein  24.04 
 
 
235 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126992  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0401  hypothetical protein  31.09 
 
 
206 aa  48.5  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.71715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0522  hypothetical protein  30.69 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265718  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2018  hypothetical protein  24.1 
 
 
220 aa  48.5  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0322  hypothetical protein  25.49 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3642  hypothetical protein  31.15 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.24777  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5062  sterol-binding domain-containing protein  27.46 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4886  hypothetical protein  27.46 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0869  hypothetical protein  34.71 
 
 
192 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781426  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0798  hypothetical protein  34.71 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5012  hypothetical protein  27.46 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45420  hypothetical protein  27.96 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.471069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0453  sterol-binding domain-containing protein  27.32 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663917  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4009  hypothetical protein  38.3 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000604567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4210  hypothetical protein  24.76 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4217  hypothetical protein  25.42 
 
 
201 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66910  hypothetical protein  31.09 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4306  hypothetical protein  25.99 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03727  hypothetical protein  25.99 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03489  hypothetical protein  21.63 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5275  hypothetical protein  25.42 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0592137  normal  0.315828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4174  sterol-binding domain-containing protein  25.99 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4355  hypothetical protein  25.99 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.963397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4058  hypothetical protein  25.99 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03676  hypothetical protein  25.99 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4145  Sterol-binding domain protein  25.99 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0543  hypothetical protein  24.19 
 
 
211 aa  42.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5151  hypothetical protein  26.23 
 
 
207 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>