More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0916 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
335 aa  671    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  61.2 
 
 
337 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  61.2 
 
 
320 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  60.5 
 
 
354 aa  358  9e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  56.07 
 
 
321 aa  346  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6286  transcriptional regulator, AraC family  57.01 
 
 
320 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  55.45 
 
 
320 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  55.76 
 
 
320 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  55.45 
 
 
320 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3598  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 
313 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167816  normal  0.0986203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0228  ThiJ/PfpI domain protein  40.92 
 
 
313 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000506965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5129  transcriptional regulator, AraC family  42.22 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  34.56 
 
 
330 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  31.4 
 
 
331 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  33.09 
 
 
336 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  31.01 
 
 
347 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  30.72 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  38.97 
 
 
323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  30.72 
 
 
347 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 
342 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 
341 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 
335 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  30.63 
 
 
325 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
335 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31.94 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  34.73 
 
 
340 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  31.46 
 
 
320 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  32.05 
 
 
330 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  28.57 
 
 
324 aa  124  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  29.74 
 
 
345 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 
326 aa  123  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 
332 aa  123  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  32.1 
 
 
347 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.91 
 
 
326 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 
346 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  33.03 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  33.17 
 
 
327 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 
340 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  28.22 
 
 
331 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  31.95 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 
332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  26.46 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
343 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
330 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  28.62 
 
 
330 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 
332 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 
330 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  32.59 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  26.01 
 
 
334 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  23.6 
 
 
325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  29.12 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  24.07 
 
 
321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
333 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 
334 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 
313 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
299 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  27.38 
 
 
306 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  28.4 
 
 
334 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  26.79 
 
 
335 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 
321 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
321 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 
332 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
321 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
321 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
321 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  32.16 
 
 
312 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
316 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 
326 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 
321 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  27.63 
 
 
361 aa  106  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.24 
 
 
327 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 
320 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  30.2 
 
 
313 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 
314 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 
322 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 
321 aa  103  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 
332 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  28.44 
 
 
361 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 
326 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  28.08 
 
 
336 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0326  transcriptional regulator  33.33 
 
 
323 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237468  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  25.79 
 
 
348 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
324 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>