22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0847 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0847  membrane protein-like  100 
 
 
255 aa  510  1e-144  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3580  hypothetical protein  29.84 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  33.85 
 
 
176 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0336  hypothetical protein  29.45 
 
 
177 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0308  hypothetical protein  29.45 
 
 
177 aa  59.7  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3618  hypothetical protein  28.75 
 
 
172 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0504408  normal  0.0132377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1043  membrane protein of uknown function UCP014873  26.88 
 
 
187 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0884518 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  26.55 
 
 
176 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1480  hypothetical protein  30.65 
 
 
301 aa  52.8  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0445  membrane protein of uknown function UCP014873  30.67 
 
 
163 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1648  membrane protein of unknown function UCP014873  28 
 
 
168 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3602  membrane protein of unknown function UCP014873  29.05 
 
 
174 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  30.16 
 
 
173 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1452  membrane protein of unknown function UCP014873  30.91 
 
 
163 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2386  hypothetical protein  30.47 
 
 
166 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1917  membrane protein of uknown function UCP014873  33.33 
 
 
163 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00615975  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1893  membrane protein of uknown function UCP014873  33.33 
 
 
163 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3781  membrane protein of uknown function UCP014873  29.37 
 
 
172 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.579535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1291  hypothetical protein  28.93 
 
 
169 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3156  membrane protein of unknown function UCP014873  30.77 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  26.87 
 
 
182 aa  42.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4746  membrane protein of uknown function UCP014873  30.33 
 
 
168 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>