41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0722 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  100 
 
 
930 aa  1893    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  38.6 
 
 
911 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  33.08 
 
 
913 aa  438  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  31 
 
 
862 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  31.11 
 
 
872 aa  409  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  33.63 
 
 
896 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.99 
 
 
916 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.31 
 
 
906 aa  396  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  31.65 
 
 
940 aa  334  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  32.62 
 
 
912 aa  325  4e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  26.78 
 
 
858 aa  313  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  27.05 
 
 
858 aa  313  1e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  28.5 
 
 
922 aa  258  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.63 
 
 
935 aa  223  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  27.78 
 
 
993 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.65 
 
 
781 aa  58.2  0.0000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0479  ATP-dependent nuclease subunit B-like  26.3 
 
 
908 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.236866  hitchhiker  0.000840779 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  21.62 
 
 
969 aa  55.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  21.62 
 
 
969 aa  55.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  25.15 
 
 
1048 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  24.85 
 
 
1049 aa  55.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  26.97 
 
 
1047 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  26.44 
 
 
1047 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  25.62 
 
 
1052 aa  53.9  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  25.62 
 
 
1052 aa  53.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  31.53 
 
 
864 aa  52.8  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  26.5 
 
 
846 aa  52.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  25.59 
 
 
1052 aa  52  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  19.47 
 
 
803 aa  51.2  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  26.12 
 
 
959 aa  50.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.4 
 
 
1049 aa  50.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  24.77 
 
 
1045 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.55 
 
 
1016 aa  49.3  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  25.5 
 
 
988 aa  49.3  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  25.58 
 
 
1054 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  27.41 
 
 
1048 aa  48.9  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  24.63 
 
 
1049 aa  47  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  26.85 
 
 
991 aa  46.2  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  25.96 
 
 
1053 aa  46.2  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.47 
 
 
856 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  24.03 
 
 
865 aa  44.3  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>