214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0701 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  68.65 
 
 		 186 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.21 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  32.2 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  31.32 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  33.16 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  32.97 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  31.38 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  32.62 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  33.33 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  31.18 
 
 		 192 aa  99  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  31.72 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  31.87 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  32.4 
 
 		 191 aa  97.4  9e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  31.52 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  33.89 
 
 		 201 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  31.75 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  33.15 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  28.73 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  32.98 
 
 		 189 aa  94.4  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  30.73 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  31.22 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  35.26 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  31.35 
 
 		 206 aa  92.8  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  33.69 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  33.69 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  30.56 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  32.26 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  31.67 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  30.77 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  33.15 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  31.94 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  30.32 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  30.43 
 
 		 191 aa  87.8  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  32.97 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  29.26 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  30.39 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.47 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  31.38 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.47 
 
 		 183 aa  85.1  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  30.85 
 
 		 326 aa  84.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.5 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  31.49 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  32.11 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  32.11 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  30.69 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.65 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  32.11 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  30.57 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  30.32 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  32.97 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  31.41 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  30.94 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  28.5 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  32.09 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  28.12 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  27.17 
 
 		 299 aa  74.3  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.6 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.6 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  31.38 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  30 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  27.75 
 
 		 254 aa  67  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  28.77 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.91 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.21 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  48 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  30.77 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  25.84 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.62 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.54 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  32.29 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  32.29 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  32.29 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  41.79 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  40.26 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  40.26 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  40.26 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  43.86 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  43.48 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  48.39 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.44 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.28 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  44 
 
 		 296 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.28 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  41.67 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  40.58 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  42.03 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  40.26 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  34.88 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  32.41 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.86 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.03 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.67 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  39.34 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  40.32 
 
 		 281 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>