More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0636 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  55.04 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  56.12 
 
 
281 aa  299  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 
316 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 
316 aa  297  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 
316 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 
281 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  55.76 
 
 
281 aa  296  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  56.12 
 
 
281 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
454 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.73 
 
 
281 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
568 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
281 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
281 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
281 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
281 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  52.88 
 
 
281 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  54.12 
 
 
279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  53.96 
 
 
281 aa  288  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  53.41 
 
 
279 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  51.97 
 
 
279 aa  281  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  52.48 
 
 
284 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  50.36 
 
 
279 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  55.04 
 
 
307 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  53.42 
 
 
285 aa  249  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  52.99 
 
 
285 aa  246  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  52.99 
 
 
310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  47.1 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  54.33 
 
 
237 aa  216  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  50.91 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  48.16 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  49.77 
 
 
241 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 
235 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  50.91 
 
 
236 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  48.2 
 
 
237 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  49.09 
 
 
237 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  48.84 
 
 
264 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  48.55 
 
 
296 aa  207  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
278 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.95 
 
 
326 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  50.9 
 
 
238 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  50.9 
 
 
238 aa  202  5e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  47.51 
 
 
408 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  45.25 
 
 
326 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
410 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.92 
 
 
410 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  45.5 
 
 
237 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  47.51 
 
 
404 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  43.78 
 
 
412 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  45.78 
 
 
325 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  44.14 
 
 
328 aa  192  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  47.32 
 
 
398 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.26 
 
 
438 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  43.28 
 
 
429 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  42.49 
 
 
410 aa  189  4e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04264  3-phosphoserine phosphatase  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3610  phosphoserine phosphatase SerB  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  44.68 
 
 
418 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4623  phosphoserine phosphatase  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04229  hypothetical protein  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  45.09 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  44.26 
 
 
418 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4937  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.859759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  44.2 
 
 
322 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  40.66 
 
 
404 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.11 
 
 
415 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  45.25 
 
 
411 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  47.03 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  44.68 
 
 
404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  45.11 
 
 
404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.11 
 
 
404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  43.72 
 
 
327 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  43.84 
 
 
404 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  40.83 
 
 
406 aa  183  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  45.79 
 
 
326 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  45.79 
 
 
326 aa  183  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  42.44 
 
 
429 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  45.79 
 
 
326 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  44.64 
 
 
325 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  39.19 
 
 
306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  47.06 
 
 
296 aa  182  7e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  44.39 
 
 
398 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  46.04 
 
 
317 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  42.02 
 
 
404 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  38.19 
 
 
369 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  43.3 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  48.37 
 
 
372 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  42.06 
 
 
405 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  48.37 
 
 
327 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  37.76 
 
 
411 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>