More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0520 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0520  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  100 
 
 
440 aa  892    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2150  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  52.45 
 
 
437 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1455  SurA domain protein  52.17 
 
 
438 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.882987  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2338  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.47 
 
 
436 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.866252  normal  0.571441 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3658  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  50.58 
 
 
438 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.486041  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1723  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.43 
 
 
426 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0516  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.78 
 
 
498 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644007  normal  0.0402395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1978  Peptidylprolyl isomerase  42.89 
 
 
475 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2715  SurA domain protein  45.3 
 
 
443 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.109912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4111  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.03 
 
 
471 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0392  SurA domain  42.4 
 
 
500 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0407  SurA domain protein  42.17 
 
 
500 aa  335  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3469  SurA domain protein  43.78 
 
 
471 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.955997  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0200  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  44.23 
 
 
433 aa  333  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4011  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.86 
 
 
430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0602  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  40.54 
 
 
454 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0437  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.72 
 
 
493 aa  324  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  40.64 
 
 
430 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0553  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  40.1 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0437  SurA domain-containing protein  39.04 
 
 
439 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0403  survival protein SurA  39.04 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.369388  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4625  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.79 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07760  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  40.41 
 
 
430 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.242603  normal  0.0127418 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0434  SurA domain-containing protein  39.43 
 
 
441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.080411  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3509  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.32 
 
 
447 aa  318  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0589  SurA domain-containing protein  39.42 
 
 
451 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2628  SurA domain-containing protein  38.93 
 
 
452 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.222069  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6037  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.69 
 
 
452 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643718  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4799  SurA domain-containing protein  38.48 
 
 
441 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.597956  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2762  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.69 
 
 
452 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2710  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.44 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2737  SurA domain-containing protein  38.44 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2098  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.44 
 
 
452 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941822  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0498  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.29 
 
 
499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.307717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6034  SurA domain-containing protein  41.36 
 
 
475 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4023  putative peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.09 
 
 
453 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285362  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4862  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  42.54 
 
 
473 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.042366 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0576  survival protein SurA, putative  38.52 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0397  SurA domain-containing protein  39.25 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0872  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.55 
 
 
448 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46810  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  39.9 
 
 
432 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0780873  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0693  putative survival protein SurA  38.55 
 
 
450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0707  putative survival protein SurA  38.55 
 
 
450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2736  putative survival protein SurA  38.32 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0209  survival protein SurA, putative  38.32 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2422  putative survival protein SurA  38.32 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.30012  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2342  putative survival protein SurA  38.32 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5133  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.78 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0676  SurA domain  38.85 
 
 
453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0739  L-ribulokinase  39.45 
 
 
430 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4763  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.22 
 
 
476 aa  299  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1021  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.32 
 
 
427 aa  299  9e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4811  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.48 
 
 
482 aa  299  9e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.769109  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0918  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.66 
 
 
435 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00205446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1275  SurA domain protein  38.04 
 
 
465 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.508238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0097  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.24 
 
 
459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0203  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.02 
 
 
437 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.701939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.99 
 
 
463 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4075  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  38.77 
 
 
469 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0670  SurA domain  35.7 
 
 
447 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0351  hypothetical protein  37.12 
 
 
429 aa  279  7e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3912  SurA domain-containing protein  39.41 
 
 
464 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0376  hypothetical protein  36.34 
 
 
429 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1869  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.18 
 
 
484 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.588757  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5274  SurA domain protein  37.62 
 
 
469 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2011  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.05 
 
 
468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1573  SurA domain  35.45 
 
 
482 aa  266  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1935  SurA domain-containing protein  35.91 
 
 
463 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03412  survival protein surA  36.77 
 
 
427 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3637  survival protein surA  33.97 
 
 
434 aa  261  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3207  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.21 
 
 
434 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00341514  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3113  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.97 
 
 
434 aa  259  6e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.980889  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0991  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.45 
 
 
434 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000134867  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1081  SurA domain-containing protein  33.97 
 
 
434 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00545123  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3311  SurA domain protein  33.97 
 
 
434 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000542375  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1048  SurA domain-containing protein  33.97 
 
 
434 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000188646  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0907  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.73 
 
 
434 aa  256  7e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00235031  normal  0.382454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0979  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.73 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0726  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.68 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0221524  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1016  SurA domain-containing protein  33.73 
 
 
434 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000539949  hitchhiker  0.00270369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0881  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  35.66 
 
 
434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000301767  normal  0.688163 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2886  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.41 
 
 
434 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000330996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3830  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  35 
 
 
431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0966  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.33 
 
 
434 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000138448  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0864  SurA domain-containing protein  32.55 
 
 
434 aa  250  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000162907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3633  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.52 
 
 
431 aa  250  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3571  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.29 
 
 
434 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3442  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.29 
 
 
434 aa  249  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000041378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2817  survival protein surA  33.42 
 
 
434 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.705055  normal  0.656138 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0770  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.29 
 
 
434 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524485  normal  0.0902851 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1655  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.91 
 
 
451 aa  249  7e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3419  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  34.49 
 
 
431 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0567862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0604  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  34.05 
 
 
433 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0565  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.41 
 
 
430 aa  241  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3077  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.17 
 
 
434 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0098  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.57 
 
 
428 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0101  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.57 
 
 
428 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.002065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0096  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.57 
 
 
428 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.632638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0097  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.57 
 
 
428 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0531154  normal  0.145307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0103  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase SurA  33.57 
 
 
428 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.308469  normal  0.913442 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>