62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0455 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0455  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  547  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  54.26 
 
 
290 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  54.26 
 
 
290 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  54.26 
 
 
290 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  54.26 
 
 
290 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  54.26 
 
 
290 aa  268  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  54.26 
 
 
290 aa  268  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  53.88 
 
 
290 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  52.47 
 
 
296 aa  262  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  52.71 
 
 
289 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  53.58 
 
 
289 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  53.1 
 
 
294 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1032  membrane protein  53.21 
 
 
290 aa  260  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  52.83 
 
 
290 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  53.21 
 
 
289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1130  membrane protein  53.21 
 
 
289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1154  membrane protein  53.21 
 
 
289 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  54.7 
 
 
266 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2151  membrane protein  53.58 
 
 
289 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240263  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2401  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.7 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  39.02 
 
 
280 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2443  membrane protein-like protein  33.59 
 
 
287 aa  132  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.27 
 
 
264 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  27.65 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  25.58 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1473  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain- containing protein  27.71 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  26.94 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  25.6 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.06 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  28.3 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  25.42 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2068  membrane protein-like protein  27.9 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  25.82 
 
 
328 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  25.73 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  22.03 
 
 
316 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2269  membrane protein-like protein  24.37 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761855  hitchhiker  0.00192882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  25 
 
 
354 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.5 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  27.18 
 
 
676 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.27 
 
 
326 aa  48.9  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  24.03 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.07 
 
 
675 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  24.75 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.35 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  24.43 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.83 
 
 
309 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.44 
 
 
613 aa  46.2  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  26.73 
 
 
672 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  26.91 
 
 
651 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  25.51 
 
 
632 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  25.59 
 
 
719 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.26 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  25.59 
 
 
664 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.71 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  28.87 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3846  hypothetical protein  28.49 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  24.71 
 
 
691 aa  43.1  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  28.5 
 
 
310 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  25.43 
 
 
665 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  25.43 
 
 
665 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  25.43 
 
 
665 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>