More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0425 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  100 
 
 
261 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  51.68 
 
 
262 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  52.81 
 
 
247 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  46.47 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  43.98 
 
 
254 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  42.98 
 
 
263 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  44.54 
 
 
246 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  29.71 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.56 
 
 
247 aa  94  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.55 
 
 
263 aa  93.2  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  29.46 
 
 
243 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  27.66 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.08 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  28.98 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  27.78 
 
 
247 aa  89.4  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  27.31 
 
 
253 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  30.59 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  27.71 
 
 
270 aa  85.9  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  26.24 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  27.69 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.98 
 
 
397 aa  84  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  28.63 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  25.73 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.37 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.58 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  23.53 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  31.85 
 
 
564 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  24.79 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.39 
 
 
223 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  29.93 
 
 
393 aa  77  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  26.59 
 
 
630 aa  73.6  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  26.74 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  29.25 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  31.88 
 
 
568 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0238  D,D-heptose 1,7-bisphosphate phosphatase  33.57 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.546722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  28.8 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
383 aa  72  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  24.32 
 
 
241 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  28.69 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.3 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  28.74 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  29.64 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  26.34 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.43 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  30.67 
 
 
522 aa  69.3  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.92 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  28 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  30.53 
 
 
578 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  28.4 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  27.95 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  27.95 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  27.95 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  27.95 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  27.95 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  28.17 
 
 
325 aa  68.6  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  27.95 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  36.84 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  31.97 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  27.14 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  30.77 
 
 
227 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  23.35 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  24.31 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  27.95 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.46 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  30.86 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  29.53 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.25 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  29.2 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  31.07 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  25.93 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  27.91 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  24.32 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  25.41 
 
 
403 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.69 
 
 
400 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.04 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  32.03 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  35.77 
 
 
414 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  32.37 
 
 
384 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  29.27 
 
 
391 aa  65.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  33.93 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  34.48 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.5 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  26.56 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  31.52 
 
 
366 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.3 
 
 
393 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.04 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  29.77 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  39.02 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.23 
 
 
562 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  30.04 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.06 
 
 
393 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  30.04 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.23 
 
 
562 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  27 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>