More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0376 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 929 aa  1864    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 931 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 927 aa  534  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  33.91 
 
 		 934 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 923 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  35.79 
 
 		 924 aa  475  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  30.04 
 
 		 952 aa  336  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  27.08 
 
 		 935 aa  300  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 944 aa  298  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 955 aa  251  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  26.37 
 
 		 924 aa  234  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  25.43 
 
 		 924 aa  214  5.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 883 aa  207  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 873 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  26.41 
 
 		 933 aa  197  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 884 aa  195  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 900 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  25.52 
 
 		 918 aa  190  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  24.42 
 
 		 937 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 886 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  23.5 
 
 		 892 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 917 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 860 aa  171  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  25.44 
 
 		 924 aa  171  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.7 
 
 		 884 aa  169  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  25.97 
 
 		 931 aa  168  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.99 
 
 		 882 aa  156  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  23.74 
 
 		 917 aa  154  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  23 
 
 		 864 aa  150  9e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.01 
 
 		 729 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.25 
 
 		 883 aa  144  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 		 940 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.8 
 
 		 882 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 880 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 767 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1676 aa  124  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 878 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  22.5 
 
 		 914 aa  118  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.97 
 
 		 786 aa  118  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 886 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.52 
 
 		 1022 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  25.62 
 
 		 939 aa  114  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.18 
 
 		 1056 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.31 
 
 		 1056 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.05 
 
 		 818 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.05 
 
 		 1694 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.8 
 
 		 784 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 4079 aa  107  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.99 
 
 		 2240 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.51 
 
 		 988 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0178  hypothetical protein  26.9 
 
 		 880 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.03 
 
 		 810 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 1069 aa  100  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 927 aa  98.6  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1421 aa  98.2  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0105  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 689 aa  97.8  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688221 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4749  hypothetical protein  51.02 
 
 		 136 aa  96.3  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.495876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.43 
 
 		 1979 aa  93.6  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.56 
 
 		 689 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 566 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 729 aa  92.8  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.67 
 
 		 1138 aa  90.1  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.87 
 
 		 466 aa  89  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1276 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 		 565 aa  87.8  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.44 
 
 		 758 aa  86.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  22.17 
 
 		 887 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  30.43 
 
 		 581 aa  85.5  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  25.36 
 
 		 1077 aa  85.1  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  24.1 
 
 		 800 aa  84.7  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.94 
 
 		 373 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.4 
 
 		 462 aa  84  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.65 
 
 		 632 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  21.84 
 
 		 620 aa  83.2  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.73 
 
 		 1737 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.11 
 
 		 573 aa  82.4  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.72 
 
 		 1067 aa  82  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.33 
 
 		 624 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  29.76 
 
 		 635 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.23 
 
 		 561 aa  80.1  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 547 aa  79.7  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 572 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0694  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.75 
 
 		 577 aa  80.1  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 594 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  21.05 
 
 		 562 aa  79.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.23 
 
 		 561 aa  79.3  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.72 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 361 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01310  TPR domain protein  22.12 
 
 		 893 aa  78.6  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 448 aa  78.6  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1371 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.32 
 
 		 676 aa  78.2  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 607 aa  78.2  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  23.76 
 
 		 767 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 750 aa  76.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.93 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  23.83 
 
 		 661 aa  75.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  22.24 
 
 		 564 aa  75.5  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>