171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0354 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0354  dihydroorotase  100 
 
 
347 aa  718    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0506  dihydroorotase  67.35 
 
 
366 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.730321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1369  dihydroorotase  66.37 
 
 
345 aa  488  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1672  dihydroorotase  66.37 
 
 
345 aa  489  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.118047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2567  dihydroorotase  64.64 
 
 
354 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00114916  normal  0.384209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3357  dihydroorotase  64.35 
 
 
353 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00130334  hitchhiker  0.00000212736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0602  dihydroorotase  64.35 
 
 
353 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.065898  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2708  dihydroorotase  66.76 
 
 
354 aa  484  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2280  dihydroorotase  68.53 
 
 
345 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0464  dihydroorotase  65.88 
 
 
344 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0778376  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0109  dihydroorotase  65.49 
 
 
344 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0360377 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1057  dihydroorotase, homodimeric type  65.99 
 
 
345 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0406  dihydroorotase  65.88 
 
 
344 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128266  normal  0.0730827 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0363  dihydroorotase  66.08 
 
 
344 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.196474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0378  dihydroorotase  66.37 
 
 
344 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.363377  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0487  dihydroorotase  65.29 
 
 
344 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3762  dihydroorotase  65.31 
 
 
354 aa  474  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949617  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0192  dihydroorotase  65.31 
 
 
364 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.262393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0675  dihydroorotase  65.31 
 
 
364 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00265722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0642  dihydroorotase  65.31 
 
 
354 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0227198  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0596  dihydroorotase  65.4 
 
 
364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000432842  normal  0.478827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2521  dihydroorotase  65.79 
 
 
345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0570  dihydroorotase  65.1 
 
 
354 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000176529  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2422  dihydroorotase  63.66 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3425  dihydroorotase  63.66 
 
 
378 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000804434  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0338  dihydroorotase  63.66 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1199  dihydroorotase  63.66 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.208123  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3382  dihydroorotase  63.95 
 
 
352 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3417  dihydroorotase  63.66 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2609  dihydroorotase  63.66 
 
 
352 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1230  dihydroorotase  63.08 
 
 
352 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2457  dihydroorotase  62.76 
 
 
346 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.506767  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1024  dihydroorotase  63.77 
 
 
355 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0181499  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2613  dihydroorotase  61.4 
 
 
355 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3451  dihydroorotase  63.74 
 
 
355 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3464  dihydroorotase  62.06 
 
 
347 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0597  dihydroorotase  62.94 
 
 
343 aa  452  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000356431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1385  dihydroorotase  63.34 
 
 
346 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0860  dihydroorotase  61.22 
 
 
347 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3162  dihydroorotase  61.22 
 
 
347 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3263  dihydroorotase  61.22 
 
 
347 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2294  dihydroorotase  61.54 
 
 
343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1215  dihydroorotase  61.88 
 
 
347 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2994  dihydroorotase  61.22 
 
 
343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4020  dihydroorotase  62.17 
 
 
344 aa  443  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000255652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3438  dihydroorotase  63.85 
 
 
346 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1679  dihydroorotase  62.06 
 
 
344 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.279559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18710  dihydroorotase  62.9 
 
 
348 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.174562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4319  dihydroorotase  61.18 
 
 
359 aa  443  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.187641 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3745  dihydroorotase  62.39 
 
 
347 aa  441  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3026  dihydroorotase  62.69 
 
 
350 aa  442  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354452  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0448  dihydroorotase  61.95 
 
 
348 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1392  dihydroorotase  63.64 
 
 
348 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2075  dihydroorotase  61.47 
 
 
347 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3894  dihydroorotase  63.27 
 
 
347 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1888  dihydroorotase  61.52 
 
 
352 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000274946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1620  dihydroorotase  63.34 
 
 
348 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42657  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3695  dihydroorotase  60.93 
 
 
343 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4157  dihydroorotase, homodimeric type  62.68 
 
 
347 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.790268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1016  dihydroorotase  60.93 
 
 
343 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0854  dihydroorotase  61.58 
 
 
343 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0313  dihydroorotase  60.82 
 
 
350 aa  435  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1127  dihydroorotase  62.17 
 
 
348 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14070  dihydroorotase  63.05 
 
 
348 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1086  dihydroorotase  61.29 
 
 
348 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001337  dihydroorotase  60.23 
 
 
342 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.737954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4519  dihydroorotase  62.17 
 
 
348 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1115  dihydroorotase  61.88 
 
 
348 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4326  dihydroorotase  61.29 
 
 
348 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2428  dihydroorotase  59 
 
 
359 aa  433  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05227  dihydroorotase  60.59 
 
 
342 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3344  dihydroorotase  60.64 
 
 
343 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0995  dihydroorotase  60.93 
 
 
343 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1028  dihydroorotase  60.93 
 
 
343 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2870  dihydroorotase  59.48 
 
 
342 aa  427  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0468  dihydroorotase  57.94 
 
 
342 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1592  dihydroorotase  58.6 
 
 
343 aa  424  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000060522  normal  0.517158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00682  dihydroorotase  56.81 
 
 
348 aa  412  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0728  dihydroorotase  58.31 
 
 
342 aa  409  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0874924  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0302  dihydroorotase  56.14 
 
 
351 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1147  dihydroorotase  55.23 
 
 
347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19692  predicted protein  56.14 
 
 
356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0589  dihydroorotase  56.89 
 
 
345 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0730  dihydroorotase  56.69 
 
 
345 aa  401  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1891  dihydroorotase  55.85 
 
 
348 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2376  dihydroorotase  53.94 
 
 
343 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646336  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05731  dihydroorotase  56.27 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1613  dihydroorotase  55.19 
 
 
347 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2505  dihydroorotase  57.35 
 
 
343 aa  391  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27192  predicted protein  55.43 
 
 
382 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0150443 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29717  Dihydroorotase, mitochondrial precursor  55.43 
 
 
382 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.302162  normal  0.0124801 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0986  dihydroorotase  55.72 
 
 
348 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0584  dihydroorotase  55.1 
 
 
344 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0325  dihydroorotase  54.07 
 
 
346 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2818  dihydroorotase  53.71 
 
 
347 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.794395  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1930  dihydroorotase  54.12 
 
 
346 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0581  dihydroorotase  54.12 
 
 
346 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0130  dihydroorotase  55.09 
 
 
348 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1660  dihydroorotase  53.31 
 
 
373 aa  381  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000732749  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1577  dihydroorotase  54.17 
 
 
349 aa  381  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.232796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>