More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0338 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  100 
 
 		 147 aa  300  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  51.37 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  51.75 
 
 		 146 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  48.95 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  49.65 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  51.05 
 
 		 154 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  52.14 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 143 aa  146  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  51.72 
 
 		 145 aa  146  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  51.72 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  52.41 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  51.7 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  50.34 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  51.02 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  48.95 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  51.72 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  51.72 
 
 		 153 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  51.72 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  49.32 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  49.32 
 
 		 147 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  48.97 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  49.65 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  48.28 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  49.29 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  45.83 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  50.69 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  44.76 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  47.3 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  45.58 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  46.15 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  45.45 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  45.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  45.14 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  44.83 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  43.75 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  43.45 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  43.75 
 
 		 145 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  44.76 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  43.15 
 
 		 146 aa  120  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  42.25 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  42.86 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  44.96 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  44.2 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  42.86 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1756  CBS  40 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  41.43 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  43.45 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01671  CBS domain protein  50.98 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  39.72 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  41.27 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  40.98 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 170 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  37.41 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  35 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  38.85 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.46 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  32.86 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  35 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  35.92 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  41.53 
 
 		 125 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1696  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 		 143 aa  88.2  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28583  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  36.43 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.17 
 
 		 148 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  38.13 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  35.92 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  37.41 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  36.23 
 
 		 142 aa  84.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.7 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  38.02 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  37.7 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  35.46 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  35.51 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.97 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  35.25 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  35.51 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  35.97 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0352  putative signal transduction protein with CBS domains  35.25 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.014797 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0777  hypothetical protein  33.85 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  35.51 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2526  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.526316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0806  hypothetical protein  33.85 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  34.75 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  34.06 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.43 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  35.46 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>