More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0331 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0331  CheW protein  100 
 
 
200 aa  400  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  47.73 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  41.48 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2460  CheW protein  45.66 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.0797491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  36.46 
 
 
199 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  36.63 
 
 
200 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0991  CheW protein  35.58 
 
 
183 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.894133  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  36.9 
 
 
325 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0496  CheW protein  34.05 
 
 
344 aa  102  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0218818  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  34.06 
 
 
212 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  31.51 
 
 
167 aa  88.6  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  34.06 
 
 
212 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  30.22 
 
 
162 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  34.31 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  29.63 
 
 
183 aa  82  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  28.24 
 
 
365 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  30.66 
 
 
163 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  29.88 
 
 
163 aa  77  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  32.62 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1579  putative CheW protein  34.71 
 
 
170 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.450037  normal  0.31697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  27.89 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  29.75 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0969  CheW protein  32.89 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  30.97 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.25 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2399  CheW protein  42.71 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  26.92 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  29.3 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3202  CheW protein  28.88 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  32.39 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1247  putative CheW protein  31.25 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  30.99 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.37 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0468  putative CheW protein  29.32 
 
 
186 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0754564  normal  0.870958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  33.33 
 
 
212 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1925  CheW protein  34.45 
 
 
174 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  33.33 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  28.26 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0767  CheW protein  27.06 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  27.66 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.67 
 
 
164 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1069  CheW protein  44.21 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.691995  normal  0.156637 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  30.99 
 
 
150 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  33.82 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  27.85 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  26.39 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  27.45 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1768  CheW protein  29.52 
 
 
907 aa  69.7  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.52563  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  31.34 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1774  CheW protein  40 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.298965  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  27.69 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1708  CheW protein  43.16 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.425738  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2026  CheW protein  30 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  30.28 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3887  CheW protein  31.01 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.110248  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  25.53 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2634  CheW protein  41.05 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0117259  hitchhiker  0.00200366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.81 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  29.23 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  26.17 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  28 
 
 
157 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1423  CheW protein  35.05 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.797772  normal  0.101367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  27.74 
 
 
162 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  26.53 
 
 
165 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  26.32 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  25.97 
 
 
165 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  31.86 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  30.91 
 
 
165 aa  67  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  29.66 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  26.09 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.81 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  26.81 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  23.33 
 
 
162 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2706  CheW protein  32.61 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  24.84 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  32.74 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  29.61 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  26.15 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  24.49 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  27.27 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  25.55 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  30.56 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.67 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  26.45 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  30.3 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  27.21 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  27.21 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  30.6 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  30.3 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  28.47 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  34.31 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  34.31 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  34.31 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>