More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0304 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0304  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
268 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000278138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2750  F0F1 ATP synthase subunit A  79.48 
 
 
267 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000190697  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4316  F0F1 ATP synthase subunit A  52.81 
 
 
264 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00103283  hitchhiker  0.000000000108391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4372  F0F1 ATP synthase subunit A  52.81 
 
 
264 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000188927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4513  F0F1 ATP synthase subunit A  52.81 
 
 
264 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00041275  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3517  F0F1 ATP synthase subunit A  48.88 
 
 
266 aa  271  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3931  F0F1 ATP synthase subunit A  52.06 
 
 
264 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  hitchhiker  0.00676688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4023  F0F1 ATP synthase subunit A  52.06 
 
 
264 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.040016  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4136  F0F1 ATP synthase subunit A  52.43 
 
 
264 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000152507  hitchhiker  0.00113608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4753  F0F1 ATP synthase subunit A  51.31 
 
 
264 aa  268  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4371  F0F1 ATP synthase subunit A  49.28 
 
 
278 aa  267  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000324643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3650  F0F1 ATP synthase subunit A  52.61 
 
 
264 aa  266  2e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000146441  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3851  F0F1 ATP synthase subunit A  50.94 
 
 
264 aa  265  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000751121  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4492  F0F1 ATP synthase subunit A  50.56 
 
 
264 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000648141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4051  F0F1 ATP synthase subunit A  50.94 
 
 
264 aa  264  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4904  F0F1 ATP synthase subunit A  50.19 
 
 
264 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000512006  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0430  F0F1 ATP synthase subunit A  46.82 
 
 
265 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000235432  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3059  F0F1 ATP synthase subunit A  45.88 
 
 
278 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2916  F0F1 ATP synthase subunit A  45.88 
 
 
278 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0491  F0F1 ATP synthase subunit A  46.07 
 
 
265 aa  261  1e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000366273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3758  F0F1 ATP synthase subunit A  50.56 
 
 
264 aa  261  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000113424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03107  F0F1 ATP synthase subunit A  49.59 
 
 
251 aa  252  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0006  F0F1 ATP synthase subunit A  50.76 
 
 
259 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.219933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2951  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
283 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3314  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
283 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000501735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3974  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
289 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338825  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0185  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
283 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.690271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4048  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
289 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3361  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
289 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3009  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
289 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0278836  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1593  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
289 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000136963  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0191  F0F1 ATP synthase subunit A  44.88 
 
 
290 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.6509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0091  F0F1 ATP synthase subunit A  47.52 
 
 
282 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000844383  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0100  F0F1 ATP synthase subunit A  47.52 
 
 
282 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0156743  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0414  F0F1 ATP synthase subunit A  46.07 
 
 
287 aa  241  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.266481  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0056  F0F1 ATP synthase subunit A  47.99 
 
 
261 aa  240  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3282  F0F1 ATP synthase subunit A  47.64 
 
 
283 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3033  F0F1 ATP synthase subunit A  46.64 
 
 
283 aa  240  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0366  F0F1 ATP synthase subunit A  44.41 
 
 
292 aa  239  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864806  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0209  F0F1 ATP synthase subunit A  42.91 
 
 
283 aa  239  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4220  F0F1 ATP synthase subunit A  49.46 
 
 
274 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000114872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2522  F0F1 ATP synthase subunit A  46.52 
 
 
270 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4182  F0F1 ATP synthase subunit A  49.46 
 
 
274 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000085941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4251  F0F1 ATP synthase subunit A  49.28 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0116  F0F1 ATP synthase subunit A  47.64 
 
 
283 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452508  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2955  F0F1 ATP synthase subunit A  47.64 
 
 
283 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00187227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0100  F0F1 ATP synthase subunit A  47.64 
 
 
283 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0388655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2436  F0F1 ATP synthase subunit A  45.91 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.393005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4541  F0F1 ATP synthase subunit A  48.91 
 
 
266 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000389155  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3987  ATP synthase F0, A subunit  47.76 
 
 
260 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4188  F0F1 ATP synthase subunit A  49.44 
 
 
263 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0002  F0F1 ATP synthase subunit A  48.56 
 
 
273 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000755904  hitchhiker  0.00410129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0321  F0F1 ATP synthase subunit A  44.24 
 
 
292 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406347  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0100  F0F1 ATP synthase subunit A  47.64 
 
 
283 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0187478  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00428  F0F1 ATP synthase subunit A  45.59 
 
 
270 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04089  F0F1 ATP synthase subunit A  45.61 
 
 
277 aa  235  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0056302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  46.32 
 
 
270 aa  234  8e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4301  F0F1 ATP synthase subunit A  47.52 
 
 
270 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002024  ATP synthase A chain  45.59 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000182901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3323  F0F1 ATP synthase subunit A  45.68 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145119  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5605  ATP synthase F0, A subunit  46.21 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2875  F0F1 ATP synthase subunit A  46.84 
 
 
255 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.870432  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3080  F0F1 ATP synthase subunit A  44.24 
 
 
267 aa  231  9e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00958832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5127  F0F1 ATP synthase subunit A  45.86 
 
 
289 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00619657  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4876  F0F1 ATP synthase subunit A  44.6 
 
 
289 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3736  F0F1 ATP synthase subunit A  43.68 
 
 
267 aa  230  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.584992  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3900  F0F1 ATP synthase subunit A  45.94 
 
 
283 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3500  F0F1 ATP synthase subunit A  44.24 
 
 
289 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000120321  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0020  F0F1 ATP synthase subunit A  43.31 
 
 
291 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00150016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4126  F0F1 ATP synthase subunit A  46.95 
 
 
271 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000492327  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4208  F0F1 ATP synthase subunit A  51.82 
 
 
252 aa  229  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000900849  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3518  F0F1 ATP synthase subunit A  44.96 
 
 
293 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0559287  hitchhiker  0.0000650144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0249  F0F1 ATP synthase subunit A  43.15 
 
 
297 aa  228  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5736  F0F1 ATP synthase subunit A  46.21 
 
 
289 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000306084  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3193  F0F1 ATP synthase subunit A  44.96 
 
 
293 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.586213  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4246  F0F1 ATP synthase subunit A  44.77 
 
 
276 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000111234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0112  F0F1 ATP synthase subunit A  42.46 
 
 
296 aa  228  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000328836  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2142  F0F1 ATP synthase subunit A  42.39 
 
 
264 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4108  F0F1 ATP synthase subunit A  44.19 
 
 
266 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  8.0507200000000005e-19  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0034  F0F1 ATP synthase subunit A  45.23 
 
 
283 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0259709  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3352  F0F1 ATP synthase subunit A  44.24 
 
 
288 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1702  F0F1 ATP synthase subunit A  45.63 
 
 
265 aa  226  3e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.223985  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0182  F0F1 ATP synthase subunit A  42.39 
 
 
264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.147393  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0302  F0F1 ATP synthase subunit A  45 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73310  F0F1 ATP synthase subunit A  44.21 
 
 
289 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.529883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6362  F0F1 ATP synthase subunit A  44.21 
 
 
289 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3532  F0F1 ATP synthase subunit A  42.81 
 
 
298 aa  224  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0443347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3962  F0F1 ATP synthase subunit A  43.06 
 
 
273 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4096  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000520187  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4202  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109875  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4081  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00982626  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4261  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4152  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00217219  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0297  F0F1 ATP synthase subunit A  44.64 
 
 
287 aa  221  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0761923  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03622  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4229  ATP synthase F0, A subunit  46.24 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000742751  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5206  F0F1 ATP synthase subunit A  44.6 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4183  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000018126  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5437  F0F1 ATP synthase subunit A  44.6 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4256  F0F1 ATP synthase subunit A  46.24 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000769313  hitchhiker  0.00779566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>