155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0182 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0182  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0774687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1376  hypothetical protein  53.3 
 
 
181 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1501  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  191  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.223609  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4846  hypothetical protein  52.25 
 
 
178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.892642  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0211  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  52.57 
 
 
187 aa  174  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.506232  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0192  hypothetical protein  52 
 
 
187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2688  hypothetical protein  43.16 
 
 
188 aa  167  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.885834  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0061  hypothetical protein  53.69 
 
 
161 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.861882  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0069  hypothetical protein  53.69 
 
 
164 aa  157  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  31.17 
 
 
187 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  35.25 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0103  hypothetical protein  32.64 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4169  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.08 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2968  hypothetical protein  31.25 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.15 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  29.87 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3458  redoxin domain-containing protein  32.19 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255545  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4602  Redoxin domain protein  30.57 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12889  integral membrane C-type cytochrome biogenesis protein dipZ  35.77 
 
 
695 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.33 
 
 
699 aa  61.6  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4615  redoxin domain-containing protein  32.31 
 
 
197 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  30.66 
 
 
503 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5017  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150202  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5143  redoxin domain-containing protein  31.54 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00131261  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.46 
 
 
435 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3111  redoxin  31.78 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5256  redoxin domain-containing protein  31.78 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.6 
 
 
206 aa  58.2  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  30.25 
 
 
581 aa  57.8  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0397  hypothetical protein  30.23 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5325  redoxin domain-containing protein  29.48 
 
 
592 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.472956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35610  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  32.21 
 
 
634 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2397  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.46 
 
 
589 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  32.03 
 
 
469 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
581 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6967  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.28 
 
 
612 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0311  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.69 
 
 
466 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.359191  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38790  Peroxiredoxin  31.01 
 
 
644 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.605672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0515  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.68 
 
 
576 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.136592  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1587  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 
619 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6244  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.03 
 
 
619 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6720  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.03 
 
 
619 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5424  redoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
604 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0299  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.69 
 
 
466 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.257762  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  31.25 
 
 
622 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.69 
 
 
493 aa  54.7  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1170  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.68 
 
 
596 aa  54.3  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6664  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.72 
 
 
623 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960267  normal  0.0511098 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5960  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.72 
 
 
625 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5716  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.72 
 
 
622 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610944  normal  0.678998 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0190  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.57 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.648376  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0274  cytochrome c biogenesis protein, putative  28.57 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1252  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  20.1 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.55 
 
 
641 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  30.25 
 
 
691 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.83 
 
 
184 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2277  Redoxin domain protein  29.41 
 
 
591 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182569  normal  0.459267 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1960  hypothetical protein  34.26 
 
 
163 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.73446 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.72 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3908  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  27.91 
 
 
598 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3207  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
688 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6146  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.03 
 
 
655 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000229834  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1566  hypothetical protein  29.33 
 
 
172 aa  51.2  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5356  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.66 
 
 
626 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.363536  normal  0.314037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2089  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.53 
 
 
404 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.770973  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5707  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.68 
 
 
403 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.911728  normal  0.326453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  26.32 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.86 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.58 
 
 
639 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.94 
 
 
628 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 
672 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3069  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 
609 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0869014  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  27.74 
 
 
182 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2053  Redoxin domain protein  29.71 
 
 
589 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0186949  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  28.1 
 
 
487 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4426  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.34 
 
 
596 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0814  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.69 
 
 
589 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0530  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.81 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.120927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0596  Redoxin domain protein  25.37 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387792  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  28.22 
 
 
674 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0023  redoxin domain-containing protein  28.91 
 
 
167 aa  48.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4448  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.67 
 
 
382 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3984  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 
195 aa  48.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000964008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  23.91 
 
 
183 aa  47.8  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  28.99 
 
 
160 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4550  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.49 
 
 
487 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00323854  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3204  thioredoxin family protein, putative  26.67 
 
 
180 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00906791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2046  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  27.35 
 
 
437 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0189188  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  29.2 
 
 
504 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
612 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  28.93 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  26.45 
 
 
172 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  28.93 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1503  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.83 
 
 
437 aa  45.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873558  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.54 
 
 
612 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  29.13 
 
 
498 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  28.67 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  25.76 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>