More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0127 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  58.12 
 
 
223 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  57.08 
 
 
221 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  56.52 
 
 
243 aa  243  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  57.83 
 
 
222 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1872  nucleotidyl transferase  55.65 
 
 
236 aa  241  6e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2335  putative nucleotidyl transferase  57.02 
 
 
237 aa  239  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.512409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  57.14 
 
 
223 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  55.75 
 
 
223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1576  Nucleotidyl transferase  52.17 
 
 
238 aa  225  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  57.14 
 
 
240 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  51.48 
 
 
240 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  54.98 
 
 
223 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  53.04 
 
 
245 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  51.05 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  51.05 
 
 
240 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0394  nucleotidyl transferase  52.86 
 
 
232 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824565  normal  0.063826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  51.29 
 
 
239 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  55.17 
 
 
230 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  55.11 
 
 
223 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  51.24 
 
 
250 aa  217  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  49.38 
 
 
232 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  54.46 
 
 
223 aa  214  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  50.65 
 
 
240 aa  214  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  53.25 
 
 
229 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  51.74 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  55.56 
 
 
223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  49.13 
 
 
230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  56 
 
 
223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  55.56 
 
 
223 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  48.7 
 
 
234 aa  211  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2631  nucleotidyl transferase  49.14 
 
 
239 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311513  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  52.7 
 
 
222 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0433  nucleotidyl transferase  48.71 
 
 
232 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.73488  normal  0.148714 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  51.52 
 
 
229 aa  209  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  49.12 
 
 
241 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2765  nucleotidyl transferase  49.14 
 
 
239 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3512  nucleotidyl transferase  52.86 
 
 
228 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0573  nucleotidyltransferase family protein  49.57 
 
 
239 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  50.41 
 
 
239 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  49.13 
 
 
239 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  51.77 
 
 
222 aa  208  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  50 
 
 
241 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  48.7 
 
 
239 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  48.7 
 
 
239 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  48.7 
 
 
239 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  48.7 
 
 
239 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  53.22 
 
 
222 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  48.7 
 
 
231 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  51.77 
 
 
221 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0910  nucleotidyl transferase  51.33 
 
 
222 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00048093  normal  0.372808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  54.22 
 
 
224 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  48.26 
 
 
239 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0673  Nucleotidyl transferase  48.46 
 
 
242 aa  205  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  50.22 
 
 
225 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  53.71 
 
 
232 aa  203  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  49.78 
 
 
226 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0556  nucleotidyltransferase family protein  54.67 
 
 
210 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  50.22 
 
 
225 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  50.22 
 
 
225 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  50.88 
 
 
232 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  53.33 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  50.22 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  49.79 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  50.66 
 
 
222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  51.54 
 
 
228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  49.57 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  50.22 
 
 
229 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  50.22 
 
 
229 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4828  nucleotidyl transferase  50.43 
 
 
232 aa  191  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1752  nucleotidyl transferase  46.35 
 
 
251 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000589238 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  44.98 
 
 
240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  44.69 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  44.94 
 
 
240 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  44.44 
 
 
220 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  44.44 
 
 
220 aa  175  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  42.8 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  44.26 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  45.26 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1696  nucleotidyl transferase  42.42 
 
 
242 aa  172  5.999999999999999e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.114305  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  47.37 
 
 
230 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1517  nucleotidyl transferase  42.04 
 
 
246 aa  166  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.631437  normal  0.41315 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0257  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  44.44 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  42.29 
 
 
219 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  42.29 
 
 
219 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4057  nucleotidyl transferase  41.94 
 
 
245 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5261  Nucleotidyl transferase  43.85 
 
 
236 aa  158  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0085  nucleotidyl transferase  42.44 
 
 
272 aa  154  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  40.48 
 
 
274 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0937  nucleotidyl transferase  44.13 
 
 
272 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3308  nucleotidyl transferase  42.23 
 
 
271 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3958  nucleotidyl transferase  42.23 
 
 
271 aa  146  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0194  nucleotidyl transferase  43.43 
 
 
247 aa  142  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0983981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4583  nucleotidyl transferase  41.41 
 
 
263 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.693762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
244 aa  122  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  34.5 
 
 
232 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  34.2 
 
 
239 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 
245 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
240 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>