144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0073 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0073  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  332  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1004  HPP family protein+B94  60.95 
 
 
169 aa  192  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.83368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  37.01 
 
 
189 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  34.19 
 
 
190 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  39.22 
 
 
190 aa  92.8  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  39.68 
 
 
184 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  40.48 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  38.76 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  38.1 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  38.89 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  37.3 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 
199 aa  84  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  39.52 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  33.33 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  36.99 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3702  HPP family protein?  34.97 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.25118  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  39.81 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1745  hypothetical protein  35.86 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0908487  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  36.14 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  36.75 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  36.14 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  36.14 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  34.75 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  35.21 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  37.61 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  30.97 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  36.14 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  36.14 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  42.53 
 
 
169 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  30.72 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  39.37 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1160  HPP family protein+B94  37.84 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.925167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  37.98 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  37.98 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  36.14 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  34.92 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  35.54 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  35.54 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  35.19 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  34.52 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  38.46 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0877  HPP family protein  29.93 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.1998  hitchhiker  0.0000199483 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001161  HPP family protein  34.88 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1680  HPP family protein+B94  32.28 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000210288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3149  HPP family protein  39.47 
 
 
165 aa  67.4  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0075242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2511  HPP family protein  36.04 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0952568  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  36.73 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  32.65 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  33.55 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  34.92 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  38.79 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  33.9 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0551  HPP  40.66 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  35.46 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  64.7  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  30.39 
 
 
383 aa  64.3  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  35.92 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  38.14 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 
449 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  34.96 
 
 
178 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2802  HPP family protein  37.11 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2885  HPP family protein  38.14 
 
 
159 aa  62.4  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0299  HPP family protein+B94  35.96 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0192  HPP family protein?  36.84 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.644029  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  36.79 
 
 
379 aa  62  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  35.04 
 
 
178 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  36.49 
 
 
368 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  31.2 
 
 
207 aa  61.2  0.000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  36.79 
 
 
373 aa  61.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  31.48 
 
 
394 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  44.74 
 
 
374 aa  60.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0947  HPP family protein  37.68 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  34.11 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  41.56 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  42.86 
 
 
378 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
361 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  33.09 
 
 
379 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  33.09 
 
 
379 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  33.8 
 
 
404 aa  57.8  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  39.62 
 
 
387 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
384 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  41.56 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  40.79 
 
 
382 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  40.79 
 
 
346 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  40.79 
 
 
416 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
373 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  39.78 
 
 
391 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  40.79 
 
 
397 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  40.79 
 
 
397 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64520  predicted protein  32.11 
 
 
286 aa  56.6  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0252407  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  40.79 
 
 
465 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  40.79 
 
 
382 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  39.78 
 
 
391 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
391 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 
399 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  29.22 
 
 
324 aa  54.7  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.47 
 
 
397 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
379 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>