More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0064 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  100 
 
 
420 aa  852  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  66.27 
 
 
419 aa  577  1e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0054  phage integrase family site specific recombinase  66.03 
 
 
422 aa  572  1e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4162  integrase family protein  65.56 
 
 
422 aa  569  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  65.79 
 
 
439 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2709  putative prophage integrase  67.65 
 
 
418 aa  563  1e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  61.19 
 
 
420 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  2.99734e-06 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  63.76 
 
 
425 aa  527  1e-148  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  44.55 
 
 
432 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4160  phage integrase family protein  43.31 
 
 
419 aa  319  7e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0690268  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001829  integrase  42.13 
 
 
405 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.854488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  39.76 
 
 
404 aa  274  2e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  40.38 
 
 
403 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.51154e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  40.87 
 
 
404 aa  254  2e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04051  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.65 
 
 
415 aa  243  4e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0550  phage integrase family protein  38.77 
 
 
413 aa  240  3e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0350  phage integrase family protein  37.3 
 
 
427 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.73479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  37.07 
 
 
410 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  36.55 
 
 
414 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  36.55 
 
 
409 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  36.03 
 
 
409 aa  202  1e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  35.64 
 
 
409 aa  199  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  33.09 
 
 
414 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  32.84 
 
 
414 aa  196  5e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  34.16 
 
 
413 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  33.11 
 
 
440 aa  186  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  33.88 
 
 
403 aa  183  4e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  34.79 
 
 
414 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  34.07 
 
 
410 aa  176  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  31.04 
 
 
406 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  32.43 
 
 
414 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  32.82 
 
 
413 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4258  phage integrase family site specific recombinase  37.25 
 
 
293 aa  166  7e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  30.81 
 
 
415 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6547  integrase family protein  29.59 
 
 
455 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352142  normal  0.0182485 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  29.26 
 
 
404 aa  159  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33 
 
 
404 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33 
 
 
404 aa  158  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  33 
 
 
404 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  31.85 
 
 
413 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0318  hypothetical protein  29.79 
 
 
515 aa  156  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  31.8 
 
 
420 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3983  integrase family protein  32.96 
 
 
404 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  31.39 
 
 
389 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  28.88 
 
 
446 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  33.93 
 
 
394 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  30.98 
 
 
399 aa  154  3e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  31.08 
 
 
445 aa  153  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  29.84 
 
 
426 aa  153  6e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  30.94 
 
 
410 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  31.94 
 
 
400 aa  152  9e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  31.77 
 
 
402 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  29.74 
 
 
402 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  31.22 
 
 
378 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  30.73 
 
 
400 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  31.46 
 
 
400 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  7.70896e-14  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  28.76 
 
 
439 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  29.76 
 
 
439 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  30.67 
 
 
394 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  31.68 
 
 
402 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  30.42 
 
 
397 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  33.42 
 
 
402 aa  148  2e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5642  Phage integrase  30.71 
 
 
403 aa  148  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  7.34e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  30.71 
 
 
399 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  28.89 
 
 
411 aa  147  4e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  30.9 
 
 
404 aa  147  4e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  29.88 
 
 
418 aa  146  8e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3112  integrase family protein  30.23 
 
 
412 aa  146  8e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.053252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  30.5 
 
 
481 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.37436e-09  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  31.08 
 
 
428 aa  145  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  29.34 
 
 
411 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  30.08 
 
 
426 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  31.15 
 
 
387 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  28.92 
 
 
449 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  28.18 
 
 
390 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  29.45 
 
 
406 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  29.1 
 
 
398 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  30.2 
 
 
395 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  30.79 
 
 
401 aa  143  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  31.71 
 
 
401 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3112  integrase family protein  30.2 
 
 
418 aa  142  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  29.35 
 
 
403 aa  142  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  30.41 
 
 
401 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  30.43 
 
 
396 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  29.19 
 
 
417 aa  142  2e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  31.97 
 
 
409 aa  141  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.69 
 
 
419 aa  141  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3062  phage integrase  29.68 
 
 
418 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361431  normal  0.0996208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  29.9 
 
 
418 aa  140  4e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  29.43 
 
 
395 aa  140  5e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  31.68 
 
 
406 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  30.73 
 
 
396 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3366  phage integrase family protein  30.67 
 
 
394 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2845  phage integrase family protein  28.68 
 
 
409 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  0.121401 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  30.36 
 
 
404 aa  137  3e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  29.43 
 
 
418 aa  137  3e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  29.66 
 
 
421 aa  137  3e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  26.25 
 
 
434 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  30.26 
 
 
405 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  30.15 
 
 
402 aa  137  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>