More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0047 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0047  transposase IS4  100 
 
 
177 aa  362  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.683119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0621  transposase IS4  100 
 
 
177 aa  362  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0830  transposase IS4  100 
 
 
177 aa  362  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.172478  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2019  transposase IS4  100 
 
 
177 aa  362  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2650  transposase IS4  100 
 
 
177 aa  362  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0180  transposase, IS4  57.32 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.501437  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0435  transposase, IS4  57.32 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1015  transposase, IS4  57.32 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.186494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1934  transposase, IS4  57.32 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  58.27 
 
 
255 aa  164  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0083  hypothetical protein  49.67 
 
 
249 aa  150  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2046  hypothetical protein  49.02 
 
 
249 aa  148  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2631  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 
113 aa  144  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2617  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 
113 aa  144  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699065  normal  0.338204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4302  transposase, IS4 family protein  58.93 
 
 
113 aa  144  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.657565  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4381  transposase, IS4 family protein  57.52 
 
 
113 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.537387  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4715  transposase, IS4 family protein  58.04 
 
 
113 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.54309 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8144  transposase IS4 family protein  52.24 
 
 
135 aa  141  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0677  transposase, IS4  51.47 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.321651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0225  transposase, IS4  50.74 
 
 
164 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1053  transposase, IS4  50.74 
 
 
164 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.133687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1352  transposase, IS4  50.74 
 
 
164 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.238339  normal  0.0658866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3066  transposase, IS4  50.74 
 
 
164 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.298578  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  54.55 
 
 
254 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  54.55 
 
 
254 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  54.55 
 
 
254 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  54.55 
 
 
254 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  54.55 
 
 
254 aa  135  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  47.18 
 
 
253 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  49.31 
 
 
260 aa  133  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0836  IS4 family transposase  87.84 
 
 
75 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  47.18 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  47.18 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  47.18 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  55.3 
 
 
254 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  55.3 
 
 
254 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  55.3 
 
 
254 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  55.3 
 
 
254 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  55.3 
 
 
254 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  55.3 
 
 
254 aa  132  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0973  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.922887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1282  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.080194  normal  0.261741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1592  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2473  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2498  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2824  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2861  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2923  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3013  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3037  transposase, IS4  57.63 
 
 
122 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  46.9 
 
 
253 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3116  transposase, IS4  57.63 
 
 
157 aa  131  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.206046  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0006  transposase, IS4  56.78 
 
 
122 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345636  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  52.63 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0537  transposase, IS4 family protein  42.11 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246162 
 
 
-
 
NC_004310  BR0534  ISBm1, transposase orfB  52.99 
 
 
138 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.162326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1158  transposase  51.85 
 
 
138 aa  128  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0538  ISBm1, transposase orfB  52.99 
 
 
138 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4937  transposase, IS4 family protein  48.18 
 
 
235 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00831349  normal  0.350186 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5939  hypothetical protein  45.45 
 
 
266 aa  125  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.754111  normal  0.0437323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0310  transposase, IS4  44.37 
 
 
210 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1095  transposase, IS4  44.37 
 
 
210 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.282833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2919  transposase, IS4  44.37 
 
 
210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2121  hypothetical protein  54.63 
 
 
113 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  121  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  120  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  45 
 
 
252 aa  120  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  45 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09600  Transposase, IS4  46.15 
 
 
245 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2976  transposase, IS4 family protein  41.67 
 
 
186 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2092  transposase, IS4 family protein  41.67 
 
 
186 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.663064  normal  0.152141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0317  transposase, IS4 family protein  43.06 
 
 
250 aa  117  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0611775  hitchhiker  0.0000000841064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1675  transposase, IS4 family protein  43.06 
 
 
250 aa  117  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000531811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3104  putative transposase  58.7 
 
 
96 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.660761  normal  0.0351076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0250  transposase IS4 family protein  48.15 
 
 
142 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00554315  hitchhiker  0.00627953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2677  transposase IS4 family protein  48.15 
 
 
142 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183927  normal  0.153389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3333  transposase, IS4 family protein  40.97 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.505103 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  45.65 
 
 
260 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  45.65 
 
 
260 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1761  hypothetical protein  41.96 
 
 
149 aa  115  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.997929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  45.65 
 
 
260 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  45.65 
 
 
260 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  43.84 
 
 
167 aa  115  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7671  transposase  49.22 
 
 
131 aa  114  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2960  transposase, IS4 family protein  41.33 
 
 
336 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  48.84 
 
 
273 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1820  transposase, IS4 family protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0796894  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3789  hypothetical protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3795  hypothetical protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1552  transposase, IS4 family protein  44.2 
 
 
252 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185337  normal  0.508935 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3849  hypothetical protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0531772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1805  transposase, IS4 family protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1815  transposase, IS4 family protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0486007  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3493  hypothetical protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887255  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3322  hypothetical protein  40.94 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0338257  normal  0.289383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>